RARG基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RARG(维甲酸受体γ)是核受体超家族成员,参与细胞分化、增殖与凋亡调控,与急性早幼粒细胞白血病(APL)的发病机制密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RARG |
|---|---|
| 基因全名 | retinoic acid receptor gamma |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12q13.13 |
| NCBI Gene ID | 5916 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5916 |
| Ensembl ID | ENSG00000172819 |
| UniProt ID | P13631 |
| OMIM ID | 180190 |
| HGNC ID | 9865 |
| 基因别名 | NR1B3; RARC; RAR-gamma |
基因功能与研究简介
RARG(维甲酸受体γ)是核受体超家族的一员,属于维甲酸受体(RAR)家族。该基因编码的蛋白质是配体激活的转录因子,与维甲酸(retinoic acid)结合后,调控靶基因的表达,参与细胞分化、增殖、凋亡等过程。RARG在胚胎发育、上皮细胞分化、免疫调节等方面发挥重要作用。RARG的异常与多种疾病相关,尤其是急性早幼粒细胞白血病(APL)中,RARG的融合基因(如PML-RARG)是重要的致病因素。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 急性早幼粒细胞白血病(APL) | RARG基因与PML基因发生融合,形成PML-RARG融合蛋白,导致维甲酸信号通路异常,阻断粒细胞分化,促进白血病发生。 | 已明确致病 |
| 急性髓系白血病(AML) | RARG的突变或异常表达可能参与AML的发生,但具体机制尚不完全清楚。 | 具有较强研究证据 |
| 实体瘤 | RARG在多种实体瘤中表达异常,可能影响肿瘤细胞的分化和增殖,但具体作用尚在研究中。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HL-60 | 暂无可靠数据 | 早幼粒细胞白血病细胞系 |
| NB4 | 暂无可靠数据 | APL细胞系,携带PML-RARA融合基因,但RARG表达情况需进一步验证 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| PML-RARG融合 | 基因融合 | 罕见 | 导致维甲酸信号通路异常,阻断分化,促进白血病发生 |
| RARG点突变 | 错义突变 | 罕见 | 可能影响受体功能,但具体影响需进一步研究 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RARG的功能缺失突变可能导致维甲酸信号减弱,影响细胞分化,但具体证据有限。
Gain of Function(功能获得,GOF)
RARG的融合蛋白(如PML-RARG)可能获得新的功能,异常激活或抑制下游靶基因,导致细胞增殖失控。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
RARG的某些突变可能产生显性负效应,干扰正常RARG的功能,但具体证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003707 (nuclear receptor activity) | • GO:0004879 (retinoic acid receptor activity) |
| • GO:0008270 (zinc ion binding) | • GO:0042809 (vitamin D receptor binding) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0000122 (negative regulation of transcription by RNA polymerase II) | • GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| • GO:0008284 (positive regulation of cell population proliferation) | • GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) |
| • GO:0008544 (epidermis development) |
相关通路
• Pathway: RAR activation (Reactome: R-HSA-5365859)
• Pathway: Retinoic acid receptors-mediated signaling (KEGG: hsa00830)
• Pathway: Nuclear receptor transcription pathway (WikiPathways: WP287)
蛋白质功能简介
RARG蛋白是维甲酸受体家族的一员,由462个氨基酸组成,包含DNA结合域和配体结合域。该蛋白作为配体激活的转录因子,与维甲酸结合后,形成同源或异源二聚体,结合到靶基因的维甲酸反应元件(RARE)上,调控基因表达。RARG在胚胎发育、上皮细胞分化、免疫调节等过程中发挥关键作用。其异常与急性早幼粒细胞白血病(APL)密切相关,PML-RARG融合蛋白是APL的致病驱动因素之一。
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