RARRES1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RARRES1(维甲酸受体应答蛋白1)是一种在细胞分化、凋亡及肿瘤抑制中发挥重要作用的蛋白,其表达异常与多种癌症及皮肤病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RARRES1 |
|---|---|
| 基因全名 | retinoic acid receptor responder 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3q25.32 |
| NCBI Gene ID | 5918 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5918 |
| Ensembl ID | ENSG00000118849 |
| UniProt ID | P49788 |
| OMIM ID | 60504 |
| HGNC ID | 9867 |
| 基因别名 | TIG1, RIG1, LXNR, PPARγ |
基因功能与研究简介
RARRES1(retinoic acid receptor responder 1)基因编码一种维甲酸受体应答蛋白,最初被鉴定为维甲酸诱导基因。该蛋白在细胞分化、凋亡和细胞周期调控中发挥作用,并被认为是一种潜在的肿瘤抑制因子。RARRES1在多种组织中表达,其表达下调与多种癌症的发生发展相关。此外,RARRES1还参与角质形成细胞的分化,与皮肤病如银屑病有关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 前列腺癌 | RARRES1表达下调或启动子甲基化导致其失活,可能促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | RARRES1表达降低与肿瘤侵袭性增加相关,可能通过调控细胞凋亡和增殖。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RARRES1在肺癌中表达下调,可能作为肿瘤抑制因子。 | 研究证据 |
| 结直肠癌 | RARRES1表达异常与结直肠癌的发生相关。 | 研究证据 |
| 银屑病 | RARRES1在银屑病皮损中表达上调,可能参与角质形成细胞过度增殖。 | 研究证据 |
| 黑色素瘤 | RARRES1表达下调与黑色素瘤进展相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 皮肤 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HaCaT | 暂无可靠数据 | 角质形成细胞系 |
| MCF-7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| PC-3 | 暂无可靠数据 | 前列腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始 |
| c.256C>T (p.Arg86Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| 启动子甲基化 | 表观遗传改变 | 常见 | 导致基因沉默 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RARRES1功能缺失突变或启动子甲基化导致蛋白表达下调或失活,可能促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明RARRES1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明RARRES1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005737 (cytoplasm) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0043066 (negative regulation of apoptotic process) |
| • GO:0008285 (negative regulation of cell population proliferation) |
相关通路
• Retinoic acid signaling pathway
• Apoptosis signaling pathway
• Cell cycle regulation
蛋白质功能简介
RARRES1蛋白是一种维甲酸受体应答蛋白,含有信号肽和跨膜结构域,可能定位于细胞膜或细胞质。该蛋白参与细胞分化、凋亡和细胞周期调控,并可能作为肿瘤抑制因子。其表达受维甲酸调控,在多种正常组织中表达,在多种肿瘤中表达下调。