RAVER1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RAVER1是一种RNA结合蛋白,参与mRNA剪接调控,与多种癌症和神经发育疾病相关。

基因信息卡

基因符号 RAVER1
基因全名 ribonucleoprotein, PTB-binding 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 19p13.2
NCBI Gene ID 125950 ncbi.nlm.nih.gov/gene/125950
Ensembl ID ENSG00000104951
UniProt ID Q8IY67
OMIM ID 609983
HGNC ID 29216
基因别名 FLJ10858, KIAA1973

基因功能与研究简介

RAVER1(ribonucleoprotein, PTB-binding 1)是一种RNA结合蛋白,属于RRM(RNA recognition motif)家族。它通过与PTB(polypyrimidine tract binding protein)相互作用,参与mRNA剪接的调控,影响基因表达。RAVER1在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,RAVER1可能参与神经发育和癌症发生,但其具体功能仍需进一步研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 RAVER1在多种癌症中表达异常,可能通过调控mRNA剪接影响肿瘤发生和发展。 较强研究证据
神经发育疾病 RAVER1在脑组织中高表达,可能参与神经发育过程,但具体关联尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响RNA结合功能
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能影响RNA结合和剪接调控功能。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RAVER1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明RAVER1存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0006397 (mRNA processing)
• GO:0008380 (RNA splicing) • GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa03013 (RNA transport)

蛋白质功能简介

RAVER1蛋白包含两个RRM结构域,能够结合RNA,并通过与PTB蛋白相互作用参与mRNA剪接的调控。它在细胞核中发挥作用,可能影响特定基因的可变剪接。RAVER1的异常表达或突变可能影响细胞功能,与疾病发生相关。

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