RBBP4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RBBP4是组蛋白结合蛋白,参与染色质重塑和转录调控,与多种癌症和神经发育疾病相关。

基因信息卡

基因符号 RBBP4
基因全名 RB binding protein 4, chromatin remodeling factor
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p34.3
NCBI Gene ID 5928 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5928
Ensembl ID ENSG00000162594
UniProt ID Q09028
OMIM ID 180330
HGNC ID 9887
基因别名 ['NURF55', 'RBAP48', 'CAF1C']

基因功能与研究简介

RBBP4(RB binding protein 4, chromatin remodeling factor)编码一种组蛋白结合蛋白,是多种染色质重塑复合物(如NuRD、NURF、CAF-1)的核心亚基。该蛋白通过识别组蛋白H3和H4的甲基化修饰,参与核小体组装、染色质组装和转录调控。RBBP4在细胞增殖、分化、凋亡和DNA损伤修复中发挥重要作用。研究表明,RBBP4在多种癌症中异常表达,并与肿瘤发生发展相关。此外,RBBP4还参与神经发育过程,其突变或表达异常可能与某些神经系统疾病有关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 RBBP4在多种癌症中表达异常,可能通过影响染色质重塑和转录调控促进肿瘤发生。 较强研究证据
神经发育疾病 RBBP4参与神经发育,其表达异常可能与智力障碍等疾病相关。 潜在关联
视网膜母细胞瘤 RBBP4与RB1相互作用,可能参与视网膜母细胞瘤的发生。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚肾细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Trp) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456_457del (p.Lys152fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致RBBP4蛋白功能丧失或减弱,可能影响染色质重塑和转录调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:目前暂无明确证据表明RBBP4存在功能获得突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:可能干扰正常RBBP4蛋白功能,但暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003682 (chromatin binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0006338 (chromatin remodeling) • GO:0006325 (chromatin organization)
• GO:0005634 (nucleus)

相关通路

hsa05200 (Pathways in cancer)
hsa05034 (Huntington's disease)
hsa05016 (Huntington's disease)

蛋白质功能简介

RBBP4蛋白是WD40重复蛋白家族成员,包含多个WD40结构域,介导蛋白-蛋白相互作用。它作为核心亚基参与多种染色质重塑复合物,如NuRD、NURF和CAF-1,通过识别组蛋白H3K9me3和H4K20me3等修饰,调控染色质结构和基因表达。RBBP4还参与DNA损伤修复和细胞周期调控。

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