RBBP9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RBBP9(RB结合蛋白9)是一种参与细胞周期调控和TGF-β信号通路的蛋白质,其异常表达与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RBBP9 |
|---|---|
| 基因全名 | RB binding protein 9, serine hydrolase |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20p11.23 |
| NCBI Gene ID | 10741 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10741 |
| Ensembl ID | ENSG00000101210 |
| UniProt ID | O75884 |
| OMIM ID | 605763 |
| HGNC ID | 9890 |
| 基因别名 | BOG, RBBP10, CGI-121 |
基因功能与研究简介
RBBP9(RB binding protein 9)编码一种丝氨酸水解酶,属于RB结合蛋白家族。该蛋白最初被鉴定为与视网膜母细胞瘤蛋白(RB1)相互作用的蛋白质,参与细胞周期调控。RBBP9在多种组织中表达,尤其在胰腺、肝脏和肾脏中高表达。研究表明,RBBP9在TGF-β信号通路中发挥作用,可能通过调节SMAD蛋白的活性影响细胞增殖和凋亡。此外,RBBP9在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生和发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胰腺癌 | RBBP9在胰腺癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | RBBP9在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RBBP9在结直肠癌中表达升高,可能通过调控Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤进展。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | RBBP9在乳腺癌中表达异常,与肿瘤分级和转移相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胰腺 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| PANC-1 | 暂无可靠数据 | 胰腺癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.416C>T (p.Pro139Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.538G>A (p.Gly180Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
| c.742_743insA (p.Leu248fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变:导致RBBP9蛋白活性降低或丧失,可能影响细胞周期调控和TGF-β信号通路。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得突变:增强RBBP9的酶活性或稳定性,可能促进细胞增殖和肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型RBBP9的功能,影响正常信号传导。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0016787 (hydrolase activity) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• Cell cycle (hsa04110)
蛋白质功能简介
RBBP9蛋白由321个氨基酸组成,属于丝氨酸水解酶家族。其结构包含一个保守的α/β水解酶结构域,可能参与底物水解。RBBP9在细胞质和细胞核中均有定位,与RB1相互作用,参与细胞周期调控。在TGF-β信号通路中,RBBP9可能通过调节SMAD蛋白的磷酸化状态影响信号传导。此外,RBBP9在多种肿瘤中高表达,提示其可能作为潜在的肿瘤治疗靶点。