RBBP9基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RBBP9(RB结合蛋白9)是一种参与细胞周期调控和TGF-β信号通路的蛋白质,其异常表达与多种癌症相关。

基因信息卡

基因符号 RBBP9
基因全名 RB binding protein 9, serine hydrolase
基因类型 protein-coding
染色体位置 20p11.23
NCBI Gene ID 10741 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10741
Ensembl ID ENSG00000101210
UniProt ID O75884
OMIM ID 605763
HGNC ID 9890
基因别名 BOG, RBBP10, CGI-121

基因功能与研究简介

RBBP9(RB binding protein 9)编码一种丝氨酸水解酶,属于RB结合蛋白家族。该蛋白最初被鉴定为与视网膜母细胞瘤蛋白(RB1)相互作用的蛋白质,参与细胞周期调控。RBBP9在多种组织中表达,尤其在胰腺、肝脏和肾脏中高表达。研究表明,RBBP9在TGF-β信号通路中发挥作用,可能通过调节SMAD蛋白的活性影响细胞增殖和凋亡。此外,RBBP9在多种癌症中表达异常,与肿瘤的发生和发展相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
胰腺癌 RBBP9在胰腺癌中高表达,可能通过促进细胞增殖和抑制凋亡参与肿瘤发生。 较强研究证据
肝细胞癌 RBBP9在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤侵袭和不良预后相关。 较强研究证据
结直肠癌 RBBP9在结直肠癌中表达升高,可能通过调控Wnt/β-catenin信号通路促进肿瘤进展。 潜在关联
乳腺癌 RBBP9在乳腺癌中表达异常,与肿瘤分级和转移相关。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
胰腺 暂无可靠数据 高表达
肝脏 暂无可靠数据 高表达
肾脏 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
PANC-1 暂无可靠数据 胰腺癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.416C>T (p.Pro139Leu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.538G>A (p.Gly180Arg) 错义突变 罕见 可能影响酶活性
c.742_743insA (p.Leu248fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,可能丧失功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失突变:导致RBBP9蛋白活性降低或丧失,可能影响细胞周期调控和TGF-β信号通路。

Gain of Function(功能获得,GOF)

功能获得突变:增强RBBP9的酶活性或稳定性,可能促进细胞增殖和肿瘤发生。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型RBBP9的功能,影响正常信号传导。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0016787 (hydrolase activity)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway)

相关通路

TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
Cell cycle (hsa04110)

蛋白质功能简介

RBBP9蛋白由321个氨基酸组成,属于丝氨酸水解酶家族。其结构包含一个保守的α/β水解酶结构域,可能参与底物水解。RBBP9在细胞质和细胞核中均有定位,与RB1相互作用,参与细胞周期调控。在TGF-β信号通路中,RBBP9可能通过调节SMAD蛋白的磷酸化状态影响信号传导。此外,RBBP9在多种肿瘤中高表达,提示其可能作为潜在的肿瘤治疗靶点。

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