RBCK1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RBCK1编码E3泛素连接酶,参与NF-κB信号通路和先天免疫调控,其突变与免疫缺陷和自身炎症性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RBCK1 |
|---|---|
| 基因全名 | RING finger protein 31 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20p13 |
| NCBI Gene ID | 10616 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10616 |
| Ensembl ID | ENSG00000125826 |
| UniProt ID | Q9BYM8 |
| OMIM ID | 610924 |
| HGNC ID | 15864 |
| 基因别名 | RNF31, HOIL-1, ZIBRA |
基因功能与研究简介
RBCK1(RING finger protein 31)编码一种E3泛素连接酶,属于RBR(RING-between-RING)家族。该蛋白参与线性泛素化复合物的组装,调控NF-κB信号通路和先天免疫应答。RBCK1在多种组织中表达,尤其在免疫细胞中高表达。其突变可导致免疫缺陷和自身炎症性疾病,如多器官自身免疫病和慢性炎症。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷伴自身炎症 | RBCK1突变导致线性泛素化缺陷,NF-κB信号异常,引发免疫失调和炎症。 | 已明确致病 |
| 多器官自身免疫病 | RBCK1功能丧失导致T细胞和B细胞异常活化,产生自身抗体。 | 较强研究证据 |
| 慢性炎症性疾病 | RBCK1突变与慢性炎症相关,可能涉及IL-1和TNF信号通路。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| THP-1 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.394C>T (p.Arg132*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.923G>A (p.Trp308*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1111C>T (p.Arg371*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1465C>T (p.Arg489*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RBCK1功能丧失突变导致线性泛素化缺陷,NF-κB信号受损,免疫细胞功能异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005737 - cytoplasm | • GO:0005829 - cytosol |
| • GO:0007250 - activation of NF-kappaB transcription factor | • GO:0016567 - protein ubiquitination |
| • GO:0045087 - innate immune response |
相关通路
• KEGG: hsa04064 - NF-kappa B signaling pathway
• Reactome: R-HSA-1169091 - Activation of NF-kappaB in B cells
• Reactome: R-HSA-933541 - TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
蛋白质功能简介
RBCK1蛋白(UniProt Q9BYM8)由510个氨基酸组成,包含RING finger、IBR和锌指结构域。作为线性泛素化复合物(LUBAC)的组成部分,RBCK1与HOIP和SHARPIN相互作用,催化线性泛素链的合成,调节NF-κB信号通路。该蛋白在免疫应答、炎症和细胞凋亡中发挥关键作用。