RBM17基因|RNA结合蛋白17的功能、疾病关联与突变研究
RBM17是剪接体复合物的核心组分,参与前体mRNA剪接调控,其异常表达与多种癌症及神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RBM17 |
|---|---|
| 基因全名 | RNA binding motif protein 17 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10p15.1 |
| NCBI Gene ID | 84991 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84991 |
| Ensembl ID | ENSG00000119953 |
| UniProt ID | Q96I25 |
| OMIM ID | 606935 |
| HGNC ID | 16944 |
| 基因别名 | SPF30, SPF31, Cwc2 |
基因功能与研究简介
RBM17(RNA结合基序蛋白17)是剪接体复合物的核心组分,参与前体mRNA剪接的催化步骤。该蛋白包含一个U2AF同源结构域和一个富含精氨酸/丝氨酸(RS)的结构域,能够与剪接因子相互作用,调节剪接位点的选择。RBM17在多种组织中广泛表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,RBM17的异常表达与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经退行性疾病(如脊髓小脑性共济失调)相关。此外,RBM17还参与DNA损伤应答和细胞凋亡调控。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓小脑性共济失调 | RBM17基因突变可能导致剪接异常,影响神经元功能,与SCA相关。 | OMIM |
| 乳腺癌 | RBM17在乳腺癌中高表达,可能通过调控凋亡相关基因的剪接促进肿瘤发生。 | COSMIC |
| 肺癌 | RBM17在肺癌组织中表达上调,与不良预后相关。 | COSMIC |
| 肝细胞癌 | RBM17在肝癌中表达升高,可能通过影响细胞增殖和凋亡参与肿瘤进展。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.458C>T (p.Pro153Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.112G>A (p.Gly38Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合能力 |
| c.789_790insA (p.Gln264Thrfs*19) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变导致截短蛋白,可能丧失剪接调控功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
错义突变可能产生显性负效应,干扰正常剪接复合物功能。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003723 RNA binding | • GO:0005681 spliceosomal complex |
| • GO:0006397 mRNA processing | • GO:0008380 RNA splicing |
| • GO:0005634 nucleus |
相关通路
• hsa03040 Spliceosome
• R-HSA-72163 mRNA Splicing - Major Pathway
蛋白质功能简介
RBM17蛋白由401个氨基酸组成,包含一个U2AF同源结构域(UHM)和一个RS结构域。UHM结构域负责与剪接因子U2AF65等相互作用,RS结构域参与蛋白-蛋白相互作用和亚细胞定位。RBM17是剪接体B复合物的组分,在剪接催化中发挥关键作用。此外,RBM17还参与DNA损伤应答,通过调控凋亡相关基因的剪接影响细胞命运。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|