RBM48基因|RNA结合蛋白功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RBM48是U2 snRNP复合物的核心组件,参与前体mRNA剪接,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 RBM48
基因全名 RNA binding motif protein 48
基因类型 protein-coding
染色体位置 7q21.2
NCBI Gene ID 84060 ncbi.nlm.nih.gov/gene/84060
Ensembl ID ENSG00000106344
UniProt ID Q5T8I9
OMIM ID 618428
HGNC ID 21853
基因别名 RNA-binding motif protein 48, C7orf27, FLJ20297

基因功能与研究简介

RBM48(RNA结合基序蛋白48)是U2小核核糖核蛋白(U2 snRNP)复合物的一个组分,参与前体mRNA剪接。该蛋白包含一个RNA识别基序(RRM),可能参与剪接位点的识别和剪接体的组装。RBM48在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,RBM48的突变与神经发育障碍有关,包括智力障碍和发育迟缓。此外,RBM48可能在某些癌症中异常表达,但其在肿瘤发生中的具体作用尚待研究。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 RBM48突变导致剪接异常,影响神经发育相关基因的表达,可能致病。 ClinVar, OMIM
智力障碍 RBM48突变与常染色体隐性遗传的智力障碍相关。 OMIM
发育迟缓 RBM48突变导致发育迟缓,具体机制涉及剪接缺陷。 ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
心脏 暂无可靠数据 中等表达
肝脏 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
SH-SY5Y 暂无可靠数据 神经母细胞瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123A>G (p.Ile41Met) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.456C>T (p.Arg152*) 无义突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

无义突变和移码突变导致蛋白功能丧失,可能引起疾病。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• RNA binding (GO:0003723) • mRNA splicing
• via spliceosome (GO:0000398) • U2 snRNP (GO:0005686)
• nucleus (GO:0005634)

相关通路

mRNA Splicing - Major Pathway (Reactome: R-HSA-72163)
Spliceosome (KEGG: hsa03040)

蛋白质功能简介

RBM48蛋白包含一个RNA识别基序(RRM),属于U2 snRNP复合物的核心组分。该复合物在剪接体组装中识别分支点序列,对前体mRNA剪接至关重要。RBM48可能通过与其他剪接因子相互作用,调控特定基因的剪接。其功能异常可能导致剪接缺陷,进而影响细胞功能。

相关产品

产品名称 货号 物种 基因 ID
联系我们
*
*
*
来源:
service online

  • 留言
  • You can send email to contact us.
    邮箱
  • You can send email to contact us.
    电话
    联系电话
    中国总部
    18102225074(微信同号)

  •  回到顶部