RBM7基因|RNA结合蛋白7的功能、疾病关联与突变研究
RBM7是RNA代谢和DNA损伤应答中的关键因子,其突变与脊髓性肌萎缩样综合征相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RBM7 |
|---|---|
| 基因全名 | RNA binding motif protein 7 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q23.1 |
| NCBI Gene ID | 10179 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10179 |
| Ensembl ID | ENSG00000176092 |
| UniProt ID | Q9Y580 |
| OMIM ID | 612939 |
| HGNC ID | 9904 |
| 基因别名 | RNA-binding motif protein 7; RNA-binding protein 7; RNA-binding motif protein 7 (RBM7) |
基因功能与研究简介
RBM7(RNA结合蛋白7)是一种RNA结合蛋白,属于RRM(RNA识别基序)家族。RBM7是核外泌体(exosome)的辅助因子,参与RNA加工、降解和质量控制。RBM7与ZCCHC8和MTR4形成复合物,在DNA损伤应答中发挥重要作用,通过促进RNA聚合酶II在DNA损伤位点的降解来维持基因组稳定性。RBM7突变可导致脊髓性肌萎缩样综合征(SMA-like disorder),表现为进行性肌无力和萎缩。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 脊髓性肌萎缩样综合征 | RBM7基因突变导致功能丧失,影响RNA加工和DNA损伤应答,导致运动神经元退化。 | 已明确致病 |
| 癌症 | RBM7在多种癌症中表达异常,可能通过影响RNA代谢和基因组稳定性参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.304C>T (p.Arg102Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能被无义介导的mRNA降解(NMD)清除,功能丧失。 |
| c.463G>A (p.Gly155Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RNA结合能力,导致功能部分丧失。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失):RBM7突变导致蛋白功能缺失或降低,影响RNA加工和DNA损伤应答,是脊髓性肌萎缩样综合征的主要致病机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明RBM7突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明RBM7突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • RNA binding (GO:0003723) | • nuclear exosome (RNase complex) (GO:0000177) |
| • RNA catabolic process (GO:0006401) | • DNA damage response (GO:0006974) |
相关通路
• RNA degradation (hsa03018)
• DNA damage response (hsa03430)
蛋白质功能简介
RBM7蛋白由274个氨基酸组成,包含一个RNA识别基序(RRM),定位于细胞核。RBM7是核外泌体复合物的辅助因子,与ZCCHC8和MTR4形成复合物,参与RNA的加工和降解。在DNA损伤应答中,RBM7促进RNA聚合酶II在损伤位点的降解,从而维持基因组稳定性。RBM7突变导致功能丧失,影响RNA代谢和DNA损伤应答,导致脊髓性肌萎缩样综合征。