RCL1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RCL1是RNA加工和核糖体生物发生的关键因子,其突变与神经发育障碍相关。

基因信息卡

基因符号 RCL1
基因全名 RNA terminal phosphate cyclase domain 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 9p24.1
NCBI Gene ID 10181 ncbi.nlm.nih.gov/gene/10181
Ensembl ID ENSG00000107104
UniProt ID Q9Y2P8
OMIM ID 611257
HGNC ID 17656
基因别名 RPCL1, RNA 3'-terminal phosphate cyclase-like protein

基因功能与研究简介

RCL1基因编码RNA 3'-末端磷酸环化酶结构域蛋白1,该蛋白在酵母中的同源物参与tRNA的剪接和加工,以及核糖体生物发生。在人类中,RCL1可能参与类似的RNA加工过程,但其具体功能尚未完全阐明。研究表明RCL1与神经发育有关,其突变可能导致智力障碍和发育迟缓。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 RCL1基因突变导致功能丧失,影响RNA加工和核糖体生物发生,进而影响神经发育。 ClinVar, OMIM
智力障碍 RCL1基因突变与常染色体隐性遗传的智力障碍相关。 OMIM, ClinVar

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
肾脏 暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.497G>A (p.Arg166His) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1A>G (p.Met1?) 起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RCL1基因的纯合或复合杂合突变导致功能丧失,是神经发育障碍的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003723 (RNA binding) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005730 (nucleolus) • GO:0006364 (rRNA processing)
• GO:0008033 (tRNA processing)

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
tRNA processing (Reactome: R-HSA-6782311)

蛋白质功能简介

RCL1蛋白包含RNA末端磷酸环化酶结构域,该结构域在酵母中具有RNA 3'-磷酸环化酶活性,但在人类中可能缺乏催化活性。RCL1定位于核仁,参与核糖体RNA的加工和核糖体亚基的组装。其功能异常可能导致核糖体生物发生缺陷,进而影响细胞增殖和分化,尤其在神经发育中起关键作用。

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