RD3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RD3基因编码视网膜变性蛋白3,对感光细胞存活和视网膜功能至关重要,其突变与Leber先天性黑矇和视网膜色素变性相关。

基因信息卡

基因符号 RD3
基因全名 retinal degeneration 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 1q32.3
NCBI Gene ID 6049 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6049
Ensembl ID ENSG00000116786
UniProt ID Q5T7M9
OMIM ID 180040
HGNC ID 9920
基因别名 C1orf9, RD3, retinal degeneration 3

基因功能与研究简介

RD3基因编码视网膜变性蛋白3,该蛋白在视网膜感光细胞中高表达,对感光细胞的存活和功能至关重要。RD3蛋白参与调节鸟苷酸环化酶(GC)的活性,影响cGMP水平,从而调控光转导通路。RD3基因突变可导致视网膜变性,包括Leber先天性黑矇(LCA)和视网膜色素变性(RP)。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Leber先天性黑矇 RD3基因突变导致感光细胞功能障碍和凋亡,引起严重的先天性视力丧失。 已明确致病
视网膜色素变性 RD3基因突变导致进行性视网膜变性,表现为夜盲和视野缩小。 已明确致病

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 低表达
睾丸 暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
Y79(视网膜母细胞瘤细胞系) 暂无可靠数据 内源性表达
ARPE-19(视网膜色素上皮细胞系) 暂无可靠数据 低表达
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.157C>T (p.Arg53Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.280G>A (p.Gly94Arg) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
c.IVS1+1G>A 剪接突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RD3基因突变导致蛋白功能丧失,影响感光细胞存活,是疾病的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0007601 (visual perception)
• GO:0007602 (phototransduction) • GO:0005737 (cytoplasm)
• GO:0005886 (plasma membrane)

相关通路

Phototransduction cascade (KEGG: hsa04744)
cGMP-PKG signaling pathway (KEGG: hsa04022)

蛋白质功能简介

RD3蛋白由188个氨基酸组成,分子量约21 kDa。该蛋白在视网膜感光细胞中高表达,定位于细胞质和细胞膜。RD3蛋白与鸟苷酸环化酶(GC)相互作用,调节其活性,从而影响cGMP的合成。cGMP是光转导通路中的关键第二信使,其水平异常可导致感光细胞死亡。RD3蛋白还参与感光细胞的结构维持和突触传递。

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