RDH11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RDH11编码视黄醇脱氢酶11,参与视觉循环和脂质代谢,其突变与视网膜疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RDH11 |
|---|---|
| 基因全名 | retinol dehydrogenase 11 (all-trans/9-cis/11-cis) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q24.1 |
| NCBI Gene ID | 51109 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51109 |
| Ensembl ID | ENSG00000100823 |
| UniProt ID | Q8TC12 |
| OMIM ID | 607849 |
| HGNC ID | 17964 |
| 基因别名 | ARHD, CGI-82, MGC10811, PRO497, RALR1, SDR7C3 |
基因功能与研究简介
RDH11基因编码视黄醇脱氢酶11,属于短链脱氢酶/还原酶(SDR)家族。该酶催化视黄醇(retinol)与视黄醛(retinal)之间的氧化还原反应,参与视觉循环中视黄醇的代谢,并可能涉及脂质代谢。RDH11在多种组织中表达,尤其在视网膜色素上皮(RPE)中高表达。其突变与常染色体隐性遗传的视网膜色素变性(RP)和视锥-视杆细胞营养不良(CRD)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 视网膜色素变性(Retinitis Pigmentosa) | RDH11突变导致酶活性丧失,影响视觉循环中11-顺式视黄醛的再生,导致光感受器细胞死亡。 | 已明确致病 |
| 视锥-视杆细胞营养不良(Cone-Rod Dystrophy) | RDH11突变导致视锥和视杆细胞功能异常,表现为进行性视力丧失。 | 已明确致病 |
| 非综合征性视网膜变性 | 部分RDH11突变与不典型视网膜变性相关,但证据有限。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.619C>T (p.Arg207Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.806G>A (p.Arg269His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RDH11突变导致酶活性丧失或蛋白截短,影响视觉循环中视黄醇的氧化还原反应,导致11-顺式视黄醛缺乏,进而引起视网膜变性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RDH11存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RDH11突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004745 (retinol dehydrogenase activity) | • GO:0001523 (retinoid metabolic process) |
| • GO:0005829 (cytosol) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
相关通路
• Retinol metabolism (KEGG: hsa00830)
• Visual phototransduction (KEGG: hsa04744)
蛋白质功能简介
RDH11蛋白属于短链脱氢酶/还原酶家族,定位于细胞质和内质网。它催化视黄醇氧化为视黄醛,并参与视觉循环中11-顺式视黄醛的再生。RDH11在视网膜色素上皮中高表达,对维持光感受器功能至关重要。此外,RDH11可能参与脂质代谢,但其具体底物和生理功能仍需进一步研究。