REEP3基因|基因功能、疾病关联、突变与细胞模型研究
REEP3编码内质网形态维持和膜运输相关蛋白,参与纤毛形成和细胞分裂,其突变与神经发育障碍相关。
基因信息卡
| 基因符号 | REEP3 |
|---|---|
| 基因全名 | Receptor Accessory Protein 3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 10q21.3 |
| NCBI Gene ID | 221035 ncbi.nlm.nih.gov/gene/221035 |
| Ensembl ID | ENSG00000165410 |
| UniProt ID | Q6NUK4 |
| OMIM ID | 609348 |
| HGNC ID | 16780 |
| 基因别名 | C10orf74, DP1L1, MGC131851 |
基因功能与研究简介
REEP3(Receptor Accessory Protein 3)基因编码一种内质网(ER)相关蛋白,属于REEP家族。该蛋白参与内质网形态的维持、膜运输以及纤毛的形成。REEP3在细胞分裂过程中也发挥作用,与染色体分离和细胞增殖有关。研究表明,REEP3突变可能导致神经发育障碍,如小头畸形和智力障碍。此外,REEP3在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤的发生和发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 小头畸形 | REEP3突变导致蛋白功能丧失,影响神经发育,导致小头畸形。 | ClinVar |
| 智力障碍 | REEP3突变与智力障碍相关,可能通过影响神经元迁移或突触功能。 | ClinVar |
| 癌症 | REEP3在多种癌症中表达上调,可能通过促进细胞增殖和迁移参与肿瘤进展。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.502C>T (p.Arg168Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1045A>G (p.Thr349Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
无义突变导致截短蛋白,功能丧失,与神经发育障碍相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005819 (spindle) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0006996 (organelle organization) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0005815 (microtubule organizing center) |
相关通路
• REEP3 is involved in ER morphology and membrane trafficking
• but no specific pathway ID is available.
蛋白质功能简介
REEP3蛋白定位于内质网,包含两个跨膜结构域和一个C末端DP1L1结构域。它参与内质网形态的维持,通过与其他REEP家族成员相互作用形成管状结构。REEP3还参与纤毛的形成,通过调节膜运输和细胞骨架动态。在细胞分裂中,REEP3定位于中心体和纺锤体,可能参与染色体分离。