RER1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RER1是内质网驻留蛋白,参与错误折叠蛋白的回收,维持内质网稳态,与神经退行性疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RER1 |
|---|---|
| 基因全名 | retention in endoplasmic reticulum sorting receptor 1 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1p36.32 |
| NCBI Gene ID | 11079 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11079 |
| Ensembl ID | ENSG00000157916 |
| UniProt ID | O15258 |
| OMIM ID | 607679 |
| HGNC ID | 30306 |
| 基因别名 | FLJ22318, MGC126851, MGC126853 |
基因功能与研究简介
RER1基因编码内质网驻留蛋白,该蛋白作为分选受体,参与错误折叠蛋白从内质网到高尔基体的回收,从而维持内质网稳态。RER1在多种组织中表达,尤其在分泌细胞中高表达。研究表明,RER1与神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和某些癌症相关,但其具体机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 阿尔茨海默病 | RER1参与淀粉样前体蛋白(APP)的加工,可能影响Aβ的产生,与阿尔茨海默病相关。 | 较强研究证据 |
| 癌症 | RER1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响内质网应激和蛋白质稳态参与肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456C>T (p.S152F) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变可能导致RER1蛋白活性降低,影响内质网稳态,但具体证据尚不充分。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前暂无明确证据表明RER1存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
目前暂无明确证据表明RER1存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0006886 (intracellular protein transport) | • GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport |
| • Golgi to ER) | • GO:0005794 (Golgi apparatus) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
相关通路
• REACTOME: Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
• REACTOME: ER to Golgi Anterograde Transport
蛋白质功能简介
RER1蛋白是内质网驻留蛋白,属于分选受体家族,主要定位于高尔基体,参与错误折叠蛋白的逆向运输,将其回收至内质网。该蛋白在维持内质网稳态中发挥重要作用,其功能异常可能与神经退行性疾病和肿瘤发生相关。