RETREG1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RETREG1(Reticulophagy Regulator 1)是内质网自噬的关键调控因子,其突变与遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2)相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RETREG1 |
|---|---|
| 基因全名 | Reticulophagy Regulator 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 12p13.32 |
| NCBI Gene ID | 54479 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54479 |
| Ensembl ID | ENSG00000111331 |
| UniProt ID | Q9NQC3 |
| OMIM ID | 613657 |
| HGNC ID | 25964 |
| 基因别名 | FAM134B, JK1 |
基因功能与研究简介
RETREG1(Reticulophagy Regulator 1)编码一种内质网(ER)跨膜蛋白,属于FAM134家族,是内质网自噬(ER-phagy)的关键受体。该蛋白通过其LC3相互作用区域(LIR)与自噬体膜上的LC3蛋白结合,介导内质网片段的降解,从而维持内质网稳态。RETREG1突变可导致遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2),表现为远端感觉丧失和自主神经功能障碍。此外,RETREG1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生和发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2) | RETREG1基因突变导致内质网自噬功能受损,影响神经元存活,引起周围神经病变。 | 已明确致病 |
| 癌症 | RETREG1在多种癌症中表达异常,可能通过调控内质网自噬影响肿瘤细胞存活和凋亡,但具体机制尚在研究中。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周神经 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.565C>T (p.Arg189*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1122delC (p.Leu375Trpfs*3) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1240C>T (p.Arg414*) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型):突变导致蛋白功能缺失或显著降低,如无义突变、移码突变等,常见于HSAN2患者。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明RETREG1存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明RETREG1突变具有显性负性效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000422 (autophagy of mitochondrion) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane) |
| • GO:0016021 (integral component of membrane) | • GO:0034970 (endoplasmic reticulum stress response) |
| • GO:0061709 (reticulophagy) |
相关通路
• Autophagy - other (KEGG: hsa04136)
• Mitophagy - animal (KEGG: hsa04137)
蛋白质功能简介
RETREG1蛋白是一种内质网跨膜蛋白,包含一个N端胞质结构域、四个跨膜结构域和一个C端胞质结构域。其N端含有LC3相互作用区域(LIR),能够与自噬体膜上的LC3蛋白结合,从而介导内质网片段的降解。该蛋白在维持内质网稳态中发挥关键作用,其功能异常与神经退行性疾病和癌症相关。