RETREG1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RETREG1(Reticulophagy Regulator 1)是内质网自噬的关键调控因子,其突变与遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2)相关。

基因信息卡

基因符号 RETREG1
基因全名 Reticulophagy Regulator 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 12p13.32
NCBI Gene ID 54479 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54479
Ensembl ID ENSG00000111331
UniProt ID Q9NQC3
OMIM ID 613657
HGNC ID 25964
基因别名 FAM134B, JK1

基因功能与研究简介

RETREG1(Reticulophagy Regulator 1)编码一种内质网(ER)跨膜蛋白,属于FAM134家族,是内质网自噬(ER-phagy)的关键受体。该蛋白通过其LC3相互作用区域(LIR)与自噬体膜上的LC3蛋白结合,介导内质网片段的降解,从而维持内质网稳态。RETREG1突变可导致遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2),表现为远端感觉丧失和自主神经功能障碍。此外,RETREG1在多种癌症中表达异常,可能参与肿瘤发生和发展。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
遗传性感觉和自主神经病变2型(HSAN2) RETREG1基因突变导致内质网自噬功能受损,影响神经元存活,引起周围神经病变。 已明确致病
癌症 RETREG1在多种癌症中表达异常,可能通过调控内质网自噬影响肿瘤细胞存活和凋亡,但具体机制尚在研究中。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
脊髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
外周神经 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SH-SY5Y 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.565C>T (p.Arg189*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失
c.1122delC (p.Leu375Trpfs*3) 移码突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失
c.1240C>T (p.Arg414*) 无义突变 罕见 Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能丧失型):突变导致蛋白功能缺失或显著降低,如无义突变、移码突变等,常见于HSAN2患者。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明RETREG1存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性效应):目前暂无明确证据表明RETREG1突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0000422 (autophagy of mitochondrion) • GO:0005515 (protein binding)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane)
• GO:0016021 (integral component of membrane) • GO:0034970 (endoplasmic reticulum stress response)
• GO:0061709 (reticulophagy)

相关通路

Autophagy - other (KEGG: hsa04136)
Mitophagy - animal (KEGG: hsa04137)

蛋白质功能简介

RETREG1蛋白是一种内质网跨膜蛋白,包含一个N端胞质结构域、四个跨膜结构域和一个C端胞质结构域。其N端含有LC3相互作用区域(LIR),能够与自噬体膜上的LC3蛋白结合,从而介导内质网片段的降解。该蛋白在维持内质网稳态中发挥关键作用,其功能异常与神经退行性疾病和癌症相关。

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