RFC1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RFC1基因编码复制因子C亚基1,参与DNA复制和损伤修复,其双等位基因突变是CANVAS综合征的主要遗传病因。

基因信息卡

基因符号 RFC1
基因全名 replication factor C subunit 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 4p14
NCBI Gene ID 5981 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5981
Ensembl ID ENSG00000035928
UniProt ID P35251
OMIM ID 600404
HGNC ID 9969
基因别名 A1; PO-GA; RFC140; CANVAS

基因功能与研究简介

RFC1基因编码复制因子C(RFC)的大亚基,该蛋白复合物在DNA复制和修复中作为DNA聚合酶辅助蛋白,负责加载增殖细胞核抗原(PCNA)到DNA引物-模板连接处。RFC1亚基是复合物的核心,具有ATP酶活性,参与DNA损伤应答和端粒维持。RFC1双等位基因突变(尤其是内含子2中的(AAGGG)n重复扩增)是导致小脑性共济失调、前庭神经病变和感觉神经病(CANVAS)综合征的主要遗传病因。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
小脑性共济失调、前庭神经病变和感觉神经病(CANVAS) 已明确致病:RFC1基因内含子2中的(AAGGG)n重复扩增导致剪接异常,引起RFC1功能缺失,进而导致神经退行性病变。 OMIM、ClinVar、多篇PMID研究
帕金森病 潜在关联:部分研究提示RFC1突变可能增加帕金森病风险,但证据尚不充分。 PMID: 31564598
癌症 潜在关联:RFC1表达异常可能影响DNA复制和修复,与某些癌症相关,但具体机制尚不明确。 COSMIC数据库记录部分体细胞突变,但临床意义未明

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
小脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
前庭神经节 暂无可靠数据 暂无可靠数据
背根神经节 暂无可靠数据 暂无可靠数据
全脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
SH-SY5Y 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
(AAGGG)n重复扩增(内含子2) 重复扩增 在CANVAS患者中常见,正常人群频率较低 Loss of Function:导致RFC1 mRNA剪接异常,蛋白功能缺失
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function:提前终止密码子,导致截短蛋白
c.2345del (p.Leu782fs) 移码突变 罕见 Loss of Function:移码导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RFC1突变导致蛋白功能缺失或表达降低,是CANVAS的主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RFC1突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明RFC1突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• DNA replication (GO:0006260) • DNA repair (GO:0006281)
• ATP binding (GO:0005524) • PCNA binding (GO:0030332)
• nucleus (GO:0005634)

相关通路

DNA replication (Reactome: R-HSA-69306)
Mismatch repair (KEGG: hsa03430)
Nucleotide excision repair (KEGG: hsa03420)

蛋白质功能简介

RFC1蛋白是复制因子C复合物的最大亚基,分子量约140 kDa。该复合物在DNA复制和修复中负责将PCNA加载到DNA上,是DNA聚合酶过程性的关键因子。RFC1具有ATP酶活性,通过水解ATP驱动PCNA的装载和卸载。在细胞核中,RFC1参与DNA损伤应答,与多种DNA修复通路相关。RFC1功能缺失会导致基因组不稳定,尤其在神经元中表现为进行性退行性病变。

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