RFX4基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RFX4是调控纤毛形成和Wnt信号通路的关键转录因子,其突变与神经发育疾病和肿瘤相关。

基因信息卡

基因符号 RFX4
基因全名 regulatory factor X4
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q24.23
NCBI Gene ID 5994 ncbi.nlm.nih.gov/gene/5994
Ensembl ID ENSG00000111783
UniProt ID Q5T8T0
OMIM ID 603929
HGNC ID 9984
基因别名 NYD-SP10

基因功能与研究简介

RFX4(regulatory factor X4)是RFX转录因子家族成员,编码的蛋白质含有保守的 winged-helix DNA结合结构域。RFX4在纤毛形成中发挥关键作用,通过调控纤毛相关基因的表达影响细胞信号转导。此外,RFX4参与Wnt信号通路的调节,对胚胎发育和器官形成至关重要。研究表明,RFX4的异常表达与多种疾病相关,包括神经发育障碍和某些癌症。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 RFX4突变可能导致纤毛功能障碍,影响大脑发育,与神经发育障碍相关。 ClinVar
肿瘤 RFX4在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控Wnt信号通路影响肿瘤发生发展。 COSMIC

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
暂无可靠数据 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234C>T (p.Arg412Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.567G>A (p.Trp189Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致RFX4蛋白功能丧失,可能影响纤毛形成和Wnt信号通路,与疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003677 (DNA binding) • GO:0006355 (regulation of transcription
• DNA-templated) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0060271 (cilium assembly)

相关通路

Wnt signaling pathway (WP428)
Ciliopathy (WP453)

蛋白质功能简介

RFX4蛋白属于RFX转录因子家族,含有DNA结合结构域,主要定位在细胞核中。它通过结合启动子区域调控下游基因表达,参与纤毛形成和Wnt信号通路。RFX4在胚胎发育中尤为重要,其功能异常可能导致纤毛相关疾病。

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