RGMA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RGMA(Repulsive Guidance Molecule BMP Co-receptor)是RGM家族成员,参与神经发育、轴突导向和骨形态发生蛋白(BMP)信号通路调控,与多种神经系统疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RGMA |
|---|---|
| 基因全名 | Repulsive Guidance Molecule BMP Co-receptor |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q26.1 |
| NCBI Gene ID | 56963 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56963 |
| Ensembl ID | ENSG00000182175 |
| UniProt ID | Q96B86 |
| OMIM ID | 607362 |
| HGNC ID | 30365 |
| 基因别名 | RGM, RGM-A, FLJ10037 |
基因功能与研究简介
RGMA(Repulsive Guidance Molecule BMP Co-receptor)是RGM家族成员之一,编码一种糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白。该蛋白在神经系统中高表达,参与轴突导向、神经元迁移和突触形成。RGMA作为BMP(骨形态发生蛋白)的共受体,调节BMP信号通路,影响细胞增殖、分化和凋亡。此外,RGMA还参与免疫调节和血管生成。研究表明,RGMA在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促进因子,具体作用取决于肿瘤类型。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 神经发育障碍 | RGMA突变可能影响轴突导向和神经元迁移,导致神经发育异常,但具体致病机制尚不明确。 | 暂无明确证据 |
| 癌症 | RGMA在多种癌症中表达异常,如结直肠癌、乳腺癌等,可能通过调节BMP信号通路影响肿瘤生长和转移。 | 具有较强研究证据 |
| 缺血性脑卒中 | RGMA在脑缺血后表达上调,可能抑制轴突再生,加重神经功能损伤。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 脊髓 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质母细胞瘤细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能异常 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RGMA功能缺失突变可能导致BMP信号通路异常,影响神经发育和肿瘤抑制功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RGMA存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RGMA存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005102 (signaling receptor binding) | • GO:0008046 (axon guidance receptor activity) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0007165 (signal transduction) |
| • GO:0007411 (axon guidance) | • GO:0030509 (BMP signaling pathway) |
相关通路
• BMP signaling pathway (Reactome: R-HSA-201451)
• Axon guidance (KEGG: hsa04360)
蛋白质功能简介
RGMA蛋白属于RGM家族,是一种GPI锚定蛋白,包含一个N端信号肽、一个RGD基序和一个C端GPI锚定位点。该蛋白在神经系统中高表达,作为BMP的共受体,增强BMP信号传导。RGMA还参与轴突导向,通过结合Neogenin等受体发挥排斥性导向作用。在癌症中,RGMA的表达水平与肿瘤分期和预后相关,可能通过调节BMP信号影响肿瘤细胞增殖和迁移。