RHOD基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RHOD基因编码Rho家族小GTP酶,参与细胞骨架调控、膜运输和细胞迁移,与多种癌症及发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RHOD |
|---|---|
| 基因全名 | ras homolog family member D |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 11q14.3 |
| NCBI Gene ID | 29984 ncbi.nlm.nih.gov/gene/29984 |
| Ensembl ID | ENSG00000173198 |
| UniProt ID | O00212 |
| OMIM ID | 602037 |
| HGNC ID | 10000 |
| 基因别名 | ARHD, RhoHP1 |
基因功能与研究简介
RHOD基因编码Rho家族小GTP酶RhoD,该蛋白在GDP结合(非活性)和GTP结合(活性)状态之间循环,调控细胞骨架动态、膜运输和细胞迁移。RHOD在多种组织中表达,尤其在免疫细胞和上皮细胞中水平较高。研究表明RHOD参与内体运输、细胞极性建立和细胞运动,其异常表达与多种癌症的侵袭转移相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | RHOD表达异常与肿瘤侵袭和转移相关,可能通过调控细胞骨架和细胞迁移促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | RHOD在胚胎发育中表达,可能参与器官形态发生,但具体致病性尚不明确。 | 潜在关联 |
| 免疫相关疾病 | RHOD在免疫细胞中高表达,可能参与免疫应答调节,但直接致病证据不足。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞白血病细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.344C>T (p.Pro115Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白构象和功能,但具体影响未知 |
| c.463G>A (p.Val155Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响GTP结合活性,但证据不足 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明RHOD存在明确的Loss of Function突变。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RHOD存在明确的Gain of Function突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RHOD存在明确的Dominant Negative突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003924 GTPase activity | • GO:0005525 GTP binding |
| • GO:0005737 cytoplasm | • GO:0005886 plasma membrane |
| • GO:0007015 actin filament organization | • GO:0030036 actin cytoskeleton organization |
| • GO:0016192 vesicle-mediated transport | • GO:0030032 lamellipodium assembly |
相关通路
• Rho GTPase cycle (Reactome: R-HSA-9012999)
• Rho GTPase signaling (KEGG: hsa04810)
蛋白质功能简介
RHOD蛋白属于Rho家族小GTP酶,包含保守的GTP结合结构域和效应器结合位点。在细胞中,RHOD定位于细胞质和质膜,通过循环于GDP/GTP结合状态调控下游信号通路。RHOD参与肌动蛋白细胞骨架重排、内体运输和细胞迁移,其活性受鸟苷酸交换因子(GEF)和GTP酶激活蛋白(GAP)调节。RHOD的异常表达或突变可能影响细胞运动,与肿瘤侵袭转移相关。