RIPPLY1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RIPPLY1是胚胎体节形成中的关键转录抑制因子,其突变与脊柱肋骨发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 RIPPLY1
基因全名 ripply transcriptional repressor 1
基因类型 protein-coding
染色体位置 Xq22.1
NCBI Gene ID 388585 ncbi.nlm.nih.gov/gene/388585
Ensembl ID ENSG00000182330
UniProt ID Q6ZNG0
OMIM ID 300849
HGNC ID 21305
基因别名 RIPPLY1, FLJ32942

基因功能与研究简介

RIPPLY1(ripply transcriptional repressor 1)是T-box转录因子家族的重要调控因子,在胚胎发育中参与体节形成和肌节分化。RIPPLY1通过抑制TBX6等基因的表达,调控体节边界形成和骨骼肌发育。其突变或表达异常与脊柱肋骨发育异常(如Klippel-Feil综合征)相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Klippel-Feil综合征 RIPPLY1突变导致单倍剂量不足,影响体节形成,导致颈椎融合等异常。 已明确致病
先天性脊柱畸形 RIPPLY1突变可能影响体节分节,导致脊柱畸形。 具有较强研究证据
肋骨发育异常 RIPPLY1功能缺失影响体节形成,可能导致肋骨异常。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
骨骼肌 暂无可靠数据 暂无可靠数据
心脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
H1人胚胎干细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1A>G (p.Met1?) 错义突变 罕见 可能影响翻译起始,导致功能丧失
c.2T>C (p.Met1?) 错义突变 罕见 可能影响翻译起始,导致功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RIPPLY1功能丧失突变导致单倍剂量不足,影响体节形成。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005634 (nucleus) • GO:0003714 (transcription corepressor activity)
• GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)

相关通路

Notch signaling pathway (hsa04330)
Wnt signaling pathway (hsa04310)

蛋白质功能简介

RIPPLY1蛋白是一种转录抑制因子,定位于细胞核,通过招募共抑制因子抑制靶基因(如TBX6)的转录。在胚胎体节形成中,RIPPLY1与TBX6形成负反馈回路,确保体节边界正确形成。其蛋白结构包含一个Ripply家族特有的螺旋-环-螺旋结构域,介导蛋白-蛋白相互作用。

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