RIPPLY2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RIPPLY2是胚胎体节形成中的关键转录抑制因子,其突变与脊柱肋骨发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RIPPLY2 |
|---|---|
| 基因全名 | ripply transcriptional repressor 2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q14.2 |
| NCBI Gene ID | 134466 ncbi.nlm.nih.gov/gene/134466 |
| Ensembl ID | ENSG00000124785 |
| UniProt ID | Q6P1J9 |
| OMIM ID | 609891 |
| HGNC ID | 21305 |
| 基因别名 | RIPPLY2, FLJ90013 |
基因功能与研究简介
RIPPLY2基因编码一种转录抑制因子,属于Ripply家族,在胚胎发育中参与体节形成和骨骼肌生成。该蛋白通过与T-box转录因子(如TBX6)相互作用,抑制下游基因表达,从而调控体节边界形成和骨骼发育。RIPPLY2突变与脊柱肋骨发育异常相关,包括Klippel-Feil综合征和脊柱肋骨发育不全。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Klippel-Feil综合征 | RIPPLY2突变导致蛋白功能丧失,影响体节形成,导致颈椎融合等异常。 | ClinVar, OMIM |
| 脊柱肋骨发育不全 | RIPPLY2突变可能破坏体节分节,导致肋骨和椎骨畸形。 | ClinVar, OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| H1人胚胎干细胞 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1A>G (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白功能丧失 |
| c.2T>C (p.Met1?) | 错义/起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RIPPLY2突变导致蛋白功能丧失,影响体节形成。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003714 (transcription corepressor activity) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006355 (regulation of transcription | • DNA-templated) |
| • GO:0007275 (multicellular organism development) |
相关通路
• Notch signaling pathway (involved in somitogenesis)
• Wnt signaling pathway (potential)
蛋白质功能简介
RIPPLY2蛋白是一种转录抑制因子,含有Ripply家族特有的WRPW基序,该基序可招募TLE/Groucho共抑制因子。在胚胎体节形成中,RIPPLY2通过抑制TBX6等转录因子的活性,调控体节边界形成和骨骼肌生成。其功能异常可导致脊柱和肋骨发育异常。