RNF11基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF11(Ring Finger Protein 11)是一种E3泛素连接酶,参与TGF-β信号通路和NF-κB信号通路的调控,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF11 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 11 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p32.3 |
| NCBI Gene ID | 26994 ncbi.nlm.nih.gov/gene/26994 |
| Ensembl ID | ENSG00000123091 |
| UniProt ID | Q9Y3C4 |
| OMIM ID | 612598 |
| HGNC ID | 10056 |
| 基因别名 | RNF11; CGI-123; SBP1 |
基因功能与研究简介
RNF11(Ring Finger Protein 11)是一种E3泛素连接酶,属于RING finger蛋白家族。它参与调控TGF-β信号通路和NF-κB信号通路,通过泛素化修饰影响下游信号传导。RNF11在多种组织中表达,尤其在脑和免疫细胞中水平较高。研究表明,RNF11与乳腺癌、前列腺癌等癌症的发生发展相关,并可能参与神经退行性疾病如阿尔茨海默病的病理过程。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RNF11在乳腺癌中表达异常,可能通过调控TGF-β信号通路影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 前列腺癌 | RNF11在前列腺癌中表达上调,与肿瘤侵袭性相关。 | 较强研究证据 |
| 阿尔茨海默病 | RNF11参与淀粉样蛋白前体蛋白(APP)的加工,可能影响Aβ的产生。 | 潜在关联 |
| 帕金森病 | RNF11与PINK1相互作用,参与线粒体自噬调控,可能影响帕金森病发病。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 免疫组织 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经母细胞瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.456C>T (p.R153*) | 无义突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RNF11功能丧失突变可能削弱其E3连接酶活性,导致TGF-β信号通路异常,促进肿瘤发生。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明RNF11存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
某些错义突变可能产生显性负效应,干扰野生型RNF11的功能,但证据有限。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0007179 (transforming growth factor beta receptor signaling pathway) | • GO:0007250 (activation of NF-kappaB-inducing kinase activity) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
相关通路
• TGF-beta signaling pathway (hsa04350)
• NF-kappa B signaling pathway (hsa04064)
蛋白质功能简介
RNF11蛋白由152个氨基酸组成,包含一个RING finger结构域,具有E3泛素连接酶活性。它通过与SMURF2等蛋白相互作用,调控TGF-β信号通路中受体和SMAD蛋白的泛素化降解。此外,RNF11还参与NF-κB信号通路的负反馈调节,通过泛素化修饰NEMO等蛋白抑制炎症反应。
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