RNF138基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF138编码一种E3泛素连接酶,参与DNA损伤修复、Wnt信号通路调控及蛋白质稳态维持,与多种癌症和神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF138 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 138 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 18q21.1 |
| NCBI Gene ID | 51444 ncbi.nlm.nih.gov/gene/51444 |
| Ensembl ID | ENSG00000134363 |
| UniProt ID | Q8WVD3 |
| OMIM ID | 616612 |
| HGNC ID | 17271 |
| 基因别名 | HREP, NARF, hRNF138, FLJ00322 |
基因功能与研究简介
RNF138(ring finger protein 138)编码一种含有RING指结构域的E3泛素连接酶,属于RNF138家族。该蛋白参与多种细胞过程,包括DNA损伤修复(特别是同源重组修复)、Wnt信号通路的调控、蛋白质泛素化降解以及细胞周期调控。RNF138通过其RING结构域介导泛素化,调控底物蛋白的稳定性或活性。研究表明,RNF138在多种癌症中表达异常,可能影响肿瘤的发生发展。此外,RNF138还参与神经系统的发育和功能,与某些神经退行性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | RNF138在结直肠癌中表达上调,可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | RNF138在乳腺癌中表达异常,可能影响DNA损伤修复能力,与肿瘤发生相关。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | RNF138参与神经元蛋白质稳态调控,其功能障碍可能与神经退行性疾病相关。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.Ile41Met) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,但致病性未明确 |
| c.456C>T (p.Pro152Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性,但致病性未明确 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致RNF138蛋白表达减少或活性丧失,可能影响DNA修复和Wnt信号通路,增加肿瘤风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强RNF138的E3连接酶活性,可能导致底物过度降解,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白可能干扰野生型RNF138的功能,影响正常细胞过程。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0006281 (DNA repair) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
| • GO:0005634 (nucleus) | • GO:0005829 (cytosol) |
相关通路
• Homologous recombination repair (Reactome: R-HSA-5693538)
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
蛋白质功能简介
RNF138蛋白由RING指结构域、锌指结构域和泛素相互作用基序组成,主要定位于细胞核和细胞质。作为E3泛素连接酶,RNF138催化泛素从E2酶转移到底物蛋白,参与DNA损伤修复(特别是同源重组修复)、Wnt信号通路调控以及蛋白质稳态维持。RNF138通过泛素化修饰调控多种底物蛋白的稳定性或活性,从而影响细胞周期、凋亡和DNA损伤应答。