RNF139基因｜基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF139（TRC8）是一种E3泛素连接酶，参与脂质代谢调控和肿瘤抑制，其突变与肾细胞癌等癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF139 |
|---|---|
| 基因全名 | Ring Finger Protein 139 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 8q24.13 |
| NCBI Gene ID | 11236 ncbi.nlm.nih.gov/gene/11236 |
| Ensembl ID | ENSG00000104763 |
| UniProt ID | Q8WU17 |
| OMIM ID | 603046 |
| HGNC ID | 10229 |
| 基因别名 | TRC8, HRC8, RING finger protein 139 |
基因功能与研究简介
RNF139（Ring Finger Protein 139），又称TRC8，是一种定位于内质网的E3泛素连接酶，属于RING finger蛋白家族。该基因位于染色体8q24.13，其编码蛋白参与脂质代谢调控、细胞增殖和凋亡等过程。RNF139具有肿瘤抑制功能，其突变或表达异常与多种癌症（如肾细胞癌、乳腺癌）的发生发展相关。此外，RNF139还参与调控胆固醇生物合成和细胞应激反应。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾细胞癌 | RNF139突变导致其编码蛋白功能丧失，影响脂质代谢和细胞增殖调控，促进肿瘤发生。 | 已明确致病 |
| 乳腺癌 | RNF139表达下调与乳腺癌进展相关，可能通过影响雌激素受体信号通路。 | 具有较强研究证据 |
| 前列腺癌 | RNF139在部分前列腺癌中表达异常，可能参与肿瘤抑制。 | 潜在关联 |
| 多发性骨髓瘤 | RNF139突变或表达改变在多发性骨髓瘤中被观察到，但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 前列腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| 786-O | 暂无可靠数据 | 肾癌细胞系 |
数据来源：Human Protein Atlas（proteinatlas.org）
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.136C>T (p.Arg46Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.394_395del (p.Leu132fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.500G>A (p.Arg167His) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function（功能缺失，LOF）
Loss of Function（功能丧失型突变）：导致RNF139蛋白功能缺失或减弱，影响其E3泛素连接酶活性，进而影响底物降解和信号通路调控，促进肿瘤发生。
Gain of Function（功能获得，GOF）
Gain of Function（功能获得型突变）：目前暂无明确证据表明RNF139存在功能获得型突变。
Dominant Negative（显性负效应，DN）
Dominant Negative（显性负性突变）：目前暂无明确证据表明RNF139存在显性负性突变。
查看完整突变数据：
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005783 - endoplasmic reticulum | • GO:0006511 - ubiquitin-dependent protein catabolic process |
| • GO:0008202 - steroid metabolic process | • GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• Cholesterol metabolism (Reactome: R-HSA-8957322)
蛋白质功能简介
RNF139蛋白（UniProt Q8WU17）是一种定位于内质网的E3泛素连接酶，包含RING finger结构域和跨膜区。它参与泛素-蛋白酶体途径，调控多种底物的降解，包括脂质代谢相关蛋白。RNF139通过影响胆固醇生物合成和细胞增殖信号通路发挥肿瘤抑制作用。其突变或表达异常可导致细胞增殖失控和肿瘤发生。
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