RNF144A基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF144A编码E3泛素连接酶,参与DNA损伤修复和细胞凋亡调控,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF144A |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 144A |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 2p25.1 |
| NCBI Gene ID | 9781 ncbi.nlm.nih.gov/gene/9781 |
| Ensembl ID | ENSG00000151692 |
| UniProt ID | P50876 |
| OMIM ID | 611700 |
| HGNC ID | 21629 |
| 基因别名 | FLJ12806, RNF144 |
基因功能与研究简介
RNF144A(ring finger protein 144A)编码一个含有RING finger结构域的E3泛素连接酶,属于RNF144家族。该蛋白参与泛素-蛋白酶体途径,调控多种底物的降解,从而影响DNA损伤修复、细胞周期和凋亡等关键过程。研究表明,RNF144A在多种肿瘤中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或促癌因子发挥作用,具体功能具有组织依赖性。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RNF144A在乳腺癌中表达下调,可能通过影响DNA修复和凋亡促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RNF144A在肺癌中表达异常,与不良预后相关,可能参与肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RNF144A在结直肠癌中表达下调,可能通过调控Wnt信号通路影响肿瘤发生。 | 潜在关联 |
| 卵巢癌 | RNF144A在卵巢癌中表达异常,可能影响化疗敏感性。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.456_457insA (p.Thr153AsnfsTer5) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.789G>A (p.Trp263Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变,导致RNF144A蛋白功能丧失或减弱,可能影响其底物泛素化,进而影响DNA损伤修复和凋亡,增加肿瘤风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RNF144A存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RNF144A存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0006281 (DNA repair) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
RNF144A蛋白包含RING finger结构域和B-box结构域,属于RING-type E3泛素连接酶。它通过泛素化底物蛋白(如p53、MDM2等)参与调控DNA损伤修复、细胞周期和凋亡。RNF144A在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响这些关键通路影响肿瘤发生发展。