RNF144B基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF144B编码E3泛素连接酶,参与DNA损伤修复和细胞凋亡调控,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF144B |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 144B |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6p21.31 |
| NCBI Gene ID | 255488 ncbi.nlm.nih.gov/gene/255488 |
| Ensembl ID | ENSG00000137331 |
| UniProt ID | Q7Z419 |
| OMIM ID | 616714 |
| HGNC ID | 21559 |
| 基因别名 | IBRDC2, P53RFP, RNF144B |
基因功能与研究简介
RNF144B(ring finger protein 144B)编码一种E3泛素连接酶,属于RING-between-RING(RBR)家族。该蛋白参与泛素-蛋白酶体途径,调控多种底物的降解,包括p53和DNA聚合酶β。RNF144B在DNA损伤应答、细胞凋亡和细胞周期调控中发挥重要作用。研究表明,RNF144B在多种癌症中表达异常,可能作为肿瘤抑制因子或癌基因,取决于细胞环境。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RNF144B表达下调与乳腺癌预后不良相关,可能通过调控p53稳定性影响肿瘤抑制功能。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RNF144B在肺癌中表达降低,可能参与肿瘤发生发展。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | RNF144B表达异常与结直肠癌进展相关,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
| 胶质瘤 | RNF144B在胶质瘤中表达上调,可能促进肿瘤细胞增殖。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| U87 | 暂无可靠数据 | 胶质瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.457C>T (p.Arg153Ter) | 无义突变 | 暂无可靠数据 | Loss of Function,导致截短蛋白,可能丧失E3连接酶活性。 |
| c.1120A>G (p.Thr374Ala) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白稳定性或功能,但具体影响未知。 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变,导致蛋白活性降低或丧失,可能影响DNA损伤修复和凋亡调控。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变,可能增强蛋白活性或产生新功能,但RNF144B中尚无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变,突变蛋白可能干扰野生型蛋白功能,但RNF144B中尚无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005654 (nucleoplasm) |
| • GO:0006281 (DNA repair) | • GO:0006915 (apoptotic process) |
相关通路
• p53 signaling pathway (hsa04115)
• Ubiquitin mediated proteolysis (hsa04120)
蛋白质功能简介
RNF144B蛋白属于RBR E3泛素连接酶家族,包含RING1、IBR和RING2结构域。它通过泛素化底物(如p53和DNA聚合酶β)参与调控DNA损伤修复和细胞凋亡。RNF144B的活性可能受磷酸化等翻译后修饰调控。在细胞核和细胞质中均有分布,其亚细胞定位可能影响其功能。