RNF146基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF146编码E3泛素连接酶,参与Wnt信号通路调控,与多种癌症及神经退行性疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF146 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 146 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 6q22.33 |
| NCBI Gene ID | 81876 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81876 |
| Ensembl ID | ENSG00000112210 |
| UniProt ID | Q9NTX7 |
| OMIM ID | 616636 |
| HGNC ID | 21319 |
| 基因别名 | FLJ12529, dJ1039K5.6 |
基因功能与研究简介
RNF146(ring finger protein 146)编码一种RING型E3泛素连接酶,属于RNF蛋白家族。该蛋白含有RING指结构域和PARP结合结构域,能够识别聚ADP-核糖基化(PAR化)的底物,并介导其泛素化降解。RNF146在Wnt信号通路中发挥关键作用,通过降解Axin等负调控因子,促进β-catenin的稳定和信号传导。此外,RNF146还参与DNA损伤修复、细胞凋亡等过程。研究表明,RNF146在多种肿瘤中表达异常,与肿瘤发生发展密切相关;同时,其突变或功能异常也与神经退行性疾病(如帕金森病)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 帕金森病 | RNF146基因突变可能导致其E3连接酶活性改变,影响底物降解,进而参与帕金森病的发病机制。 | OMIM |
| 结直肠癌 | RNF146在Wnt信号通路中促进β-catenin稳定,其过表达可能增强Wnt信号,促进结直肠癌的发生发展。 | COSMIC |
| 肝细胞癌 | RNF146在肝癌组织中表达上调,可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤增殖和转移。 | COSMIC |
| 乳腺癌 | RNF146表达异常与乳腺癌的侵袭性和不良预后相关,可能通过影响Wnt信号通路发挥作用。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.511C>T (p.Arg171Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与帕金森病相关 |
| c.1048G>A (p.Asp350Asn) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与帕金森病相关 |
| c.1255C>T (p.Arg419Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能,与帕金森病相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RNF146功能缺失突变可能导致其E3连接酶活性降低,影响底物降解,导致Wnt信号通路异常激活或底物积累,与疾病发生相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
RNF146功能获得突变可能增强其E3连接酶活性,导致底物过度降解,影响细胞稳态,与肿瘤发生相关。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
RNF146显性负性突变可能干扰正常蛋白的功能,导致信号通路异常,但具体机制尚需进一步研究。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0016567 (protein ubiquitination) | • GO:0060070 (canonical Wnt signaling pathway) |
相关通路
• Wnt signaling pathway (KEGG: hsa04310)
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
蛋白质功能简介
RNF146蛋白由366个氨基酸组成,包含一个RING指结构域(位于N端)和一个PARP结合结构域(位于C端)。RNF146通过其RING指结构域发挥E3泛素连接酶活性,催化底物蛋白的泛素化修饰,从而介导底物的蛋白酶体降解。其PARP结合结构域能够识别聚ADP-核糖基化(PAR化)的蛋白,从而将PAR化信号转化为泛素化信号。RNF146在Wnt信号通路中,通过降解Axin等负调控因子,促进β-catenin的稳定,进而激活下游靶基因的转录。此外,RNF146还参与DNA损伤修复、细胞凋亡等过程。