RNF168基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF168是DNA损伤修复的关键调控因子,其突变与遗传性乳腺癌和共济失调-毛细血管扩张样疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF168 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 168 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 3q29 |
| NCBI Gene ID | 165918 ncbi.nlm.nih.gov/gene/165918 |
| Ensembl ID | ENSG00000163935 |
| UniProt ID | Q9H6X2 |
| OMIM ID | 612688 |
| HGNC ID | 26661 |
| 基因别名 | RNF168, hRNF168, FLJ20144 |
基因功能与研究简介
RNF168(ring finger protein 168)编码一种E3泛素连接酶,属于RING finger蛋白家族。该蛋白在DNA损伤应答中发挥关键作用,特别是在DNA双链断裂修复中,通过泛素化组蛋白H2A和H2AX,促进DNA损伤修复蛋白如53BP1和BRCA1的招募。RNF168功能缺失会导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与遗传性乳腺癌和共济失调-毛细血管扩张样疾病(ATLD)相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RNF168突变导致DNA修复缺陷,增加基因组不稳定性,与遗传性乳腺癌风险增加相关。 | 已明确致病 |
| 共济失调-毛细血管扩张样疾病(ATLD) | RNF168纯合或复合杂合突变导致DNA修复缺陷,引起神经退行性变和免疫缺陷,类似共济失调-毛细血管扩张症。 | 已明确致病 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1195C>T (p.Arg399Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
| c.1358T>C (p.Leu453Pro) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白结构,导致功能受损 |
| c.1960C>T (p.Arg654Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致截短蛋白,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能丧失型):RNF168突变导致蛋白功能缺失,无法正常泛素化组蛋白,影响DNA修复,增加基因组不稳定性。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得型):目前暂无明确证据表明RNF168存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负效型):目前暂无明确证据表明RNF168存在显性负效型突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005634 - nucleus | • GO:0006281 - DNA repair |
| • GO:0006974 - cellular response to DNA damage stimulus | • GO:0016567 - protein ubiquitination |
| • GO:0031397 - negative regulation of protein ubiquitination | • GO:0043161 - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
相关通路
• Homologous recombination repair (HRR)
• Non-homologous end joining (NHEJ)
• Fanconi anemia pathway
• p53 signaling pathway
蛋白质功能简介
RNF168蛋白包含一个RING finger结构域,具有E3泛素连接酶活性。在DNA双链断裂后,RNF168被招募到损伤位点,泛素化组蛋白H2A和H2AX,形成K63连接的泛素链,从而招募下游修复蛋白如53BP1和BRCA1。RNF168还参与调节细胞周期检查点,确保基因组稳定性。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|