RNF170基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF170编码一种E3泛素连接酶,参与内质网相关蛋白降解,与遗传性痉挛性截瘫和视网膜变性等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF170 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 170 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 8p11.21 |
| NCBI Gene ID | 81790 ncbi.nlm.nih.gov/gene/81790 |
| Ensembl ID | ENSG00000104427 |
| UniProt ID | Q96K19 |
| OMIM ID | 614649 |
| HGNC ID | 25322 |
| 基因别名 | DKFZp434B0328, MGC26690 |
基因功能与研究简介
RNF170基因编码一种含有RING finger结构域的E3泛素连接酶,定位于内质网,参与内质网相关蛋白降解(ERAD)途径。该蛋白通过泛素化底物蛋白,调控其降解,从而维持细胞内蛋白质稳态。RNF170突变与遗传性痉挛性截瘫和视网膜变性等疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 遗传性痉挛性截瘫 | RNF170突变导致其E3连接酶活性异常,影响内质网相关蛋白降解,导致神经元功能障碍。 | 已明确致病 |
| 视网膜变性 | RNF170突变与常染色体显性遗传性视网膜变性相关,可能通过影响光感受器细胞蛋白稳态导致细胞死亡。 | 已明确致病 |
| 癌症 | RNF170在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控细胞凋亡和增殖参与肿瘤发生,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 其他组织 | 暂无可靠数据 | 广泛表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| SH-SY5Y | 暂无可靠数据 | 神经细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.506A>G (p.Tyr169Cys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或E3连接酶活性 |
| c.104C>T (p.Pro35Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.421C>T (p.Arg141Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RNF170突变可能导致E3连接酶活性丧失,影响底物泛素化,导致蛋白降解受阻。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
突变蛋白可能干扰野生型RNF170的功能,产生显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) |
| • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) | • GO:0005515 (protein binding) |
相关通路
• Endoplasmic reticulum-associated degradation (ERAD) pathway (Reactome: R-HSA-983168)
蛋白质功能简介
RNF170蛋白由170个氨基酸组成,包含一个RING finger结构域,定位于内质网。作为E3泛素连接酶,它参与ERAD途径,识别并泛素化错误折叠或未组装的蛋白,促进其降解。RNF170在神经系统中高表达,其突变可导致遗传性痉挛性截瘫和视网膜变性。