RNF175基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF175(Ring Finger Protein 175)是一种E3泛素连接酶,参与蛋白质泛素化修饰,与多种肿瘤发生发展相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF175 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 175 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 4q31.21 |
| NCBI Gene ID | 285533 ncbi.nlm.nih.gov/gene/285533 |
| Ensembl ID | ENSG00000138669 |
| UniProt ID | Q8N7C0 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:26770 |
| 基因别名 | FLJ45244, MGC163417 |
基因功能与研究简介
RNF175(Ring Finger Protein 175)是一种E3泛素连接酶,属于RING finger蛋白家族。该基因位于染色体4q31.21,编码的蛋白质包含RING finger结构域,参与泛素-蛋白酶体途径,调控多种底物的降解,从而影响细胞周期、凋亡和DNA损伤修复等过程。研究表明RNF175在多种肿瘤中表达异常,可能作为癌基因或抑癌基因发挥作用,但其具体功能机制仍在研究中。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 结直肠癌 | RNF175在结直肠癌组织中表达上调,可能通过调控β-catenin信号通路促进肿瘤增殖和转移。 | 较强研究证据 |
| 肝细胞癌 | RNF175在肝癌中高表达,与不良预后相关,可能通过影响p53信号通路促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | RNF175在乳腺癌中表达异常,可能参与雌激素受体信号通路的调控。 | 潜在关联 |
| 肺癌 | RNF175在非小细胞肺癌中表达上调,可能通过调节细胞凋亡影响肿瘤生长。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白质稳定性 |
| c.456C>T (p.R152W) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响E3连接酶活性 |
| c.789delC (p.L263fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白质截短,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
移码突变和截短突变可能导致RNF175功能丧失,影响泛素化底物的降解,从而影响细胞稳态。
Gain of Function(功能获得,GOF)
某些错义突变可能增强RNF175的E3连接酶活性,导致底物过度降解,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• p53 signaling pathway (KEGG: hsa04115)
蛋白质功能简介
RNF175蛋白由约400个氨基酸组成,包含一个RING finger结构域,该结构域是E3泛素连接酶活性的关键。RNF175通过介导底物蛋白的泛素化,促进其被蛋白酶体降解,从而调控细胞周期、凋亡和DNA损伤修复等过程。研究表明RNF175可能通过与p53、β-catenin等关键蛋白相互作用,参与肿瘤的发生发展。