RNF186基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF186是编码E3泛素连接酶的基因,在炎症性肠病中具有潜在保护作用,其功能缺失突变与溃疡性结肠炎风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF186 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 186 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 1p36.13 |
| NCBI Gene ID | 54546 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54546 |
| Ensembl ID | ENSG00000178343 |
| UniProt ID | Q9BSH1 |
| OMIM ID | 613791 |
| HGNC ID | 21598 |
| 基因别名 | FLJ33610 |
基因功能与研究简介
RNF186(ring finger protein 186)编码一个含有RING finger结构域的E3泛素连接酶,定位于内质网。该蛋白参与内质网应激反应和炎症信号通路的调控,在肠道上皮细胞中高表达。研究表明,RNF186的功能缺失突变与溃疡性结肠炎(ulcerative colitis)的发病风险相关,提示其在维持肠道免疫稳态中发挥保护作用。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 溃疡性结肠炎 | RNF186功能缺失突变(如p.R179X)导致蛋白截短,丧失E3连接酶活性,可能影响内质网应激下的细胞凋亡调控,增加溃疡性结肠炎风险。 | 已明确致病(GWAS和功能研究) |
| 炎症性肠病 | RNF186变异与炎症性肠病(包括克罗恩病)的关联证据较弱,但部分研究提示其参与肠道炎症调控。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 高表达(根据GTEx和免疫组化) |
| 小肠 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| Caco-2 | 暂无可靠数据 | 结肠癌细胞系,内源性表达 |
| HT-29 | 暂无可靠数据 | 结肠癌细胞系,内源性表达 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结肠癌细胞系,内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| p.R179X | 无义突变 | 人群频率约0.1% | 功能缺失(Loss of Function),导致蛋白截短,丧失E3连接酶活性 |
| p.M1? | 起始密码子突变 | 罕见 | 功能缺失(Loss of Function),可能影响翻译起始 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失突变(如p.R179X)导致RNF186蛋白截短或降解,丧失E3泛素连接酶活性,影响内质网应激调控,增加溃疡性结肠炎风险。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 protein binding |
| • GO:0005783 endoplasmic reticulum | • GO:0006954 inflammatory response |
| • GO:0006986 response to unfolded protein | • GO:0016567 protein ubiquitination |
相关通路
• Unfolded Protein Response (UPR) (Reactome: R-HSA-381119)
• Inflammatory bowel disease (IBD) pathway (KEGG: hsa05321)
蛋白质功能简介
RNF186蛋白由197个氨基酸组成,包含一个RING finger结构域(C3HC4型),定位于内质网。作为E3泛素连接酶,它可能通过泛素化底物参与内质网应激反应和炎症信号调控。在肠道上皮细胞中高表达,其功能缺失与溃疡性结肠炎风险相关。