RNF213基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF213基因编码一种E3泛素连接酶,参与血管生成和免疫调节,其突变与烟雾病和颅内大动脉狭窄/闭塞性疾病密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF213 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 213 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 17q25.3 |
| NCBI Gene ID | 57674 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57674 |
| Ensembl ID | ENSG00000173821 |
| UniProt ID | Q63HN8 |
| OMIM ID | 613768 |
| HGNC ID | 21339 |
| 基因别名 | C17orf27, FLJ35220, KIAA1618, MGC163417, MYMY2 |
基因功能与研究简介
RNF213基因编码一种含有RING指结构域的E3泛素连接酶,属于RNF213家族。该蛋白在血管内皮细胞中高表达,参与血管生成、细胞迁移和免疫调节等过程。RNF213基因的突变与烟雾病(Moyamoya disease)和颅内大动脉狭窄/闭塞性疾病(ICASO)密切相关,是这些疾病的重要遗传易感基因。此外,RNF213还参与脂质代谢和炎症反应,可能与其他血管疾病和肿瘤相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 烟雾病 | RNF213基因的p.R4810K(rs112735431)突变是东亚人群烟雾病的主要遗传风险因素,该突变导致蛋白功能异常,影响血管平滑肌细胞和内皮细胞的功能,导致血管内膜增厚和管腔狭窄。 | 已明确致病 |
| 颅内大动脉狭窄/闭塞性疾病 | RNF213基因的p.R4810K突变也与颅内大动脉狭窄/闭塞性疾病相关,尤其在东亚人群中,该突变显著增加疾病风险。 | 已明确致病 |
| 其他血管疾病 | RNF213基因的变异可能与其他血管疾病如动脉粥样硬化、高血压等存在潜在关联,但证据尚不充分。 | 潜在关联 |
| 癌症 | RNF213基因在多种肿瘤中表达异常,可能参与肿瘤血管生成和转移,但具体机制和临床意义尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 血管 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HUVEC | 暂无可靠数据 | 人脐静脉内皮细胞 |
| HBMEC | 暂无可靠数据 | 人脑微血管内皮细胞 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| p.R4810K (rs112735431) | SNV | 东亚人群携带率约1-2%,烟雾病患者中携带率约80% | 错义突变,导致蛋白功能改变,与烟雾病和ICASO风险显著相关 |
| p.R4810K (rs112735431) | SNV | 东亚人群携带率约1-2%,烟雾病患者中携带率约80% | 错义突变,导致蛋白功能改变,与烟雾病和ICASO风险显著相关 |
| p.R4810K (rs112735431) | SNV | 东亚人群携带率约1-2%,烟雾病患者中携带率约80% | 错义突变,导致蛋白功能改变,与烟雾病和ICASO风险显著相关 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RNF213的p.R4810K突变可能通过影响蛋白的E3泛素连接酶活性或蛋白稳定性,导致功能丧失或降低,从而影响血管内皮细胞和血管平滑肌细胞的正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RNF213突变具有功能获得效应。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
RNF213的p.R4810K突变可能以显性负性效应干扰野生型蛋白的功能,但具体机制尚需进一步研究。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity) | • GO:0005515 (protein binding) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0005829 (cytosol) |
| • GO:0005886 (plasma membrane) | • GO:0001525 (angiogenesis) |
| • GO:0006954 (inflammatory response) | • GO:0007165 (signal transduction) |
相关通路
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• VEGF signaling pathway (KEGG: hsa04370)
• HIF-1 signaling pathway (KEGG: hsa04066)
蛋白质功能简介
RNF213蛋白是一种大型的E3泛素连接酶,含有RING指结构域和AAA+ ATPase结构域。该蛋白在血管内皮细胞中高表达,参与血管生成、细胞迁移和免疫调节。RNF213通过泛素化修饰底物蛋白,调控多种信号通路,如VEGF和HIF-1通路。其突变与烟雾病和颅内大动脉狭窄/闭塞性疾病密切相关,可能通过影响血管重塑和炎症反应导致疾病发生。