RNF31基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RNF31编码HOIP蛋白,是线性泛素化复合物LUBAC的核心催化亚基,调控NF-κB信号通路,与免疫缺陷、炎症及肿瘤发生密切相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RNF31 |
|---|---|
| 基因全名 | ring finger protein 31 |
| 基因类型 | protein coding |
| 染色体位置 | 14q12 |
| NCBI Gene ID | 55072 ncbi.nlm.nih.gov/gene/55072 |
| Ensembl ID | ENSG00000092054 |
| UniProt ID | Q96EP0 |
| OMIM ID | 612487 |
| HGNC ID | 16865 |
| 基因别名 | HOIP, ZIBRA, RNF31 |
基因功能与研究简介
RNF31(ring finger protein 31)编码的蛋白HOIP(HOIL-1-interacting protein)是线性泛素化复合物LUBAC(linear ubiquitin chain assembly complex)的催化亚基。LUBAC由HOIP、HOIL-1L和SHARPIN组成,负责生成线性(M1连接的)多聚泛素链,在NF-κB信号通路、先天免疫和细胞死亡调控中发挥关键作用。HOIP通过其RING-IBR-RING(RBR)结构域催化泛素转移,其N端的PUB结构域参与去泛素化酶(如OTULIN)的相互作用。RNF31基因突变可导致免疫缺陷和炎症性疾病,并参与肿瘤发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 免疫缺陷伴炎症性肠病 | RNF31功能缺失突变导致LUBAC活性降低,NF-κB信号受损,影响免疫细胞功能,导致免疫缺陷和炎症性肠病。 | ClinVar, OMIM |
| 多发性骨髓瘤 | RNF31在骨髓瘤细胞中高表达,可能通过激活NF-κB促进肿瘤细胞存活。 | COSMIC, 文献 |
| 乳腺癌 | RNF31表达异常与乳腺癌进展相关,可能通过调控NF-κB和细胞凋亡影响肿瘤生物学。 | COSMIC, 文献 |
| 炎症性疾病 | RNF31参与调控炎症反应,其突变或表达异常可能与慢性炎症相关。 | 文献 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 外周血 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| Jurkat | 暂无可靠数据 | T细胞系 |
| U2OS | 暂无可靠数据 | 骨肉瘤细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1000C>T (p.Arg334Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function,导致蛋白截短,LUBAC活性丧失 |
| c.1504G>A (p.Glu502Lys) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或催化活性,功能影响待验证 |
| c.2041C>T (p.Arg681Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白相互作用,功能影响待验证 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):RNF31突变导致HOIP蛋白功能丧失或降低,影响LUBAC复合物的泛素化活性,进而削弱NF-κB信号传导,导致免疫缺陷和炎症。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前尚无明确证据表明RNF31存在功能获得性突变,但过表达可能增强NF-κB信号,促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):某些错义突变可能产生具有显性负性效应的蛋白,干扰正常LUBAC复合物的形成,但具体证据尚不充分。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity | • GO:0005515 - protein binding |
| • GO:0005737 - cytoplasm | • GO:0005829 - cytosol |
| • GO:0007249 - I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling | • GO:0016567 - protein ubiquitination |
| • GO:0030891 - VCB complex | • GO:0032991 - macromolecular complex |
| • GO:0043123 - positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling | • GO:0043161 - proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process |
相关通路
• NF-kappaB signaling pathway (KEGG: hsa04064)
• Ubiquitin mediated proteolysis (KEGG: hsa04120)
• TNF signaling pathway (KEGG: hsa04668)
• RIG-I-like receptor signaling pathway (KEGG: hsa04622)
蛋白质功能简介
RNF31编码的HOIP蛋白是LUBAC复合物的催化亚基,具有RING-IBR-RING(RBR)结构域,负责催化线性泛素链的形成。HOIP通过其N端的PUB结构域与去泛素化酶OTULIN相互作用,调节LUBAC活性。HOIP参与NF-κB信号通路的激活,调控炎症反应、免疫应答和细胞存活。此外,HOIP还参与DNA损伤修复和细胞凋亡的调控。RNF31的突变或表达异常与多种疾病相关,包括免疫缺陷、炎症性疾病和肿瘤。