ROBO1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
ROBO1编码轴突导向受体,参与神经系统发育和癌症进展,是重要的药物靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | ROBO1 |
|---|---|
| 基因全名 | roundabout guidance receptor 1 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 3p12.3 |
| NCBI Gene ID | 6091 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6091 |
| Ensembl ID | ENSG00000169885 |
| UniProt ID | Q9Y6N7 |
| OMIM ID | 602430 |
| HGNC ID | 10249 |
| 基因别名 | DUTT1, SAX3, ROBO1 |
基因功能与研究简介
ROBO1基因编码跨膜受体蛋白,属于免疫球蛋白超家族,是轴突导向分子Slit的受体。ROBO1在神经系统发育中发挥关键作用,调控轴突导向和神经元迁移。此外,ROBO1在多种癌症中异常表达,参与肿瘤血管生成、细胞迁移和侵袭。ROBO1还参与免疫调节和炎症反应。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性巨结肠 | ROBO1突变可能导致肠神经嵴细胞迁移异常,与先天性巨结肠相关。 | ClinVar |
| 癌症 | ROBO1在多种癌症中表达异常,如肺癌、乳腺癌、结直肠癌等,可能通过调控细胞迁移和血管生成促进肿瘤进展。 | COSMIC |
| 神经系统发育异常 | ROBO1突变与轴突导向异常相关,可能导致神经系统发育缺陷。 | OMIM |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肠 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 内源性表达 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.1234A>G (p.Lys412Glu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.2345delC (p.Pro782LeufsTer3) | 移码突变 | 罕见 | 导致截短蛋白,可能丧失功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致ROBO1蛋白功能丧失或减弱,可能影响轴突导向和细胞迁移。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0007155 - cell adhesion | • GO:0007411 - axon guidance |
| • GO:0005515 - protein binding | • GO:0005886 - plasma membrane |
相关通路
• Axon guidance (hsa04360)
• Signaling by ROBO receptors (Reactome: R-HSA-428542)
蛋白质功能简介
ROBO1蛋白是单次跨膜受体,包含免疫球蛋白样结构域和纤连蛋白III型重复序列。其胞内域含有保守的CC0、CC1、CC2和CC3基序,参与信号转导。ROBO1与配体Slit结合后,激活下游信号通路,调控细胞骨架重排和轴突导向。在癌症中,ROBO1可能通过促进血管生成和细胞迁移来促进肿瘤进展。