RPA2基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RPA2编码复制蛋白A的70 kDa亚基,在DNA复制、修复和重组中发挥核心作用,其突变与多种癌症风险相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RPA2 |
|---|---|
| 基因全名 | Replication Protein A2 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 1p35.3 |
| NCBI Gene ID | 6118 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6118 |
| Ensembl ID | ENSG00000117748 |
| UniProt ID | P15927 |
| OMIM ID | 179836 |
| HGNC ID | 10298 |
| 基因别名 | RP-A p70, REPA2, RPA70 |
基因功能与研究简介
RPA2基因编码复制蛋白A(RPA)的70 kDa亚基,RPA是一个异源三聚体单链DNA结合蛋白,在DNA复制、修复、重组和细胞周期检查点调控中发挥关键作用。RPA2作为核心亚基,负责结合单链DNA并协调与其他DNA代谢蛋白的相互作用。RPA2的磷酸化状态调控其在DNA损伤应答中的功能。RPA2的突变或表达异常与多种癌症的发生和发展相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RPA2基因多态性(如rs1131639)与乳腺癌风险增加相关,可能通过影响DNA修复能力。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RPA2表达上调与肺癌预后不良相关,可能通过促进肿瘤细胞增殖和耐药。 | 较强研究证据 |
| 卵巢癌 | RPA2高表达与卵巢癌的侵袭性和化疗耐药相关。 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | RPA2表达异常与结直肠癌的发生发展相关,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 卵巢 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| rs1131639 | SNV | 人群频率约0.3 | 位于3'UTR,可能影响miRNA结合,导致RPA2表达下调,增加癌症风险 |
| c.496A>G (p.Thr166Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RPA2的DNA结合能力,但功能影响尚不明确 |
| c.1120C>T (p.Arg374Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响RPA2与RPA1的相互作用,导致DNA修复缺陷 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
RPA2功能缺失突变可能导致DNA复制和修复缺陷,增加基因组不稳定性,与癌症易感性相关。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明RPA2存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
某些RPA2突变可能干扰野生型RPA复合物的功能,产生显性负效应,但具体实例尚不明确。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003697 - single-stranded DNA binding | • GO:0005662 - DNA replication factor A complex |
| • GO:0006281 - DNA repair | • GO:0006310 - DNA recombination |
| • GO:0006974 - cellular response to DNA damage stimulus |
相关通路
• hsa03430 - Mismatch repair
• hsa03420 - Nucleotide excision repair
• hsa03410 - Base excision repair
• hsa04110 - Cell cycle
蛋白质功能简介
RPA2蛋白是复制蛋白A(RPA)复合物的70 kDa亚基,该复合物由RPA1、RPA2和RPA3组成。RPA2包含一个单链DNA结合结构域和一个C端蛋白相互作用结构域。RPA2在DNA复制起始和延伸过程中稳定单链DNA,并在DNA损伤应答中作为检查点激酶(如ATM/ATR)的底物,磷酸化后参与激活细胞周期检查点。RPA2还与其他DNA代谢蛋白(如Rad51、XPA)相互作用,参与同源重组和核苷酸切除修复。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|