RPA3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RPA3是单链DNA结合蛋白复合物RPA的核心亚基,在DNA复制、修复和重组中发挥关键作用。
基因信息卡
| 基因符号 | RPA3 |
|---|---|
| 基因全名 | Replication Protein A3 |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 7p21.3 |
| NCBI Gene ID | 6119 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6119 |
| Ensembl ID | ENSG00000106399 |
| UniProt ID | P35244 |
| OMIM ID | 179837 |
| HGNC ID | 10293 |
| 基因别名 | REPA3, RP-A p14 |
基因功能与研究简介
RPA3(Replication Protein A3)是异源三聚体复制蛋白A(RPA)复合物的最小亚基,该复合物由RPA1、RPA2和RPA3组成。RPA在真核细胞中作为单链DNA结合蛋白,参与DNA复制、修复、重组和细胞周期检查点调控。RPA3通过与RPA2相互作用稳定复合物,并有助于DNA结合。RPA3功能异常可能导致基因组不稳定,与某些癌症和遗传性疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症(多种类型) | RPA3表达异常或突变可能影响DNA修复,导致基因组不稳定,促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 卵巢癌 | RPA3高表达与卵巢癌预后不良相关,可能作为治疗靶点。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | RPA3表达水平与乳腺癌进展相关,但具体机制尚需进一步研究。 | 潜在关联 |
| 遗传性乳腺癌和卵巢癌综合征 | 暂无明确证据表明RPA3突变直接致病,但RPA复合物功能异常可能增加癌症风险。 | 暂无明确证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 淋巴结 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.433A>G (p.Thr145Ala) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用,但功能影响未明确 |
| c.536C>T (p.Pro179Leu) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响DNA结合能力,但证据有限 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 罕见 | 可能导致蛋白翻译起始异常,功能影响未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变可能导致RPA复合物稳定性下降或DNA结合能力受损,影响DNA复制和修复。
Gain of Function(功能获得,GOF)
目前尚无明确证据表明RPA3存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变可能干扰RPA复合物正常功能,但具体实例尚未见报道。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003697 - single-stranded DNA binding | • GO:0005662 - DNA replication factor A complex |
| • GO:0006281 - DNA repair | • GO:0006260 - DNA replication |
相关通路
• hsa03430 - Mismatch repair
• hsa03420 - Nucleotide excision repair
• hsa03410 - Base excision repair
• hsa03030 - DNA replication
蛋白质功能简介
RPA3蛋白是RPA复合物的14 kDa亚基,包含一个OB-fold结构域,参与单链DNA结合。RPA3与RPA2形成紧密复合物,并通过RPA2与RPA1相互作用。RPA3对于RPA复合物的稳定性和DNA结合活性至关重要。RPA3在细胞核中表达,参与DNA代谢过程。