RPAP3基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RPAP3是RNA聚合酶II相关蛋白,参与转录调控和蛋白质复合物组装,与癌症和发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 RPAP3
基因全名 RNA polymerase II associated protein 3
基因类型 protein-coding
染色体位置 12q13.12
NCBI Gene ID 79657 ncbi.nlm.nih.gov/gene/79657
Ensembl ID ENSG00000111011
UniProt ID Q9H6T3
OMIM ID 611465
HGNC ID 24136
基因别名 CGI-130, HSPC239, MGC117215, RPAP3

基因功能与研究简介

RPAP3(RNA polymerase II associated protein 3)编码一个与RNA聚合酶II相关的蛋白,参与转录调控和蛋白质复合物的组装。该蛋白是R2TP复合物的组成部分,该复合物在多种细胞过程中发挥关键作用,包括端粒酶组装、PI3K样激酶信号通路和DNA损伤应答。RPAP3在多种组织中表达,其异常表达与某些癌症和发育异常相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
癌症 RPAP3在多种癌症中表达上调,可能通过影响R2TP复合物功能促进肿瘤发生和发展。 较强研究证据
发育异常 RPAP3基因突变可能导致发育异常,但具体机制尚不明确。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 暂无可靠数据
HEK293 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白功能
c.567delC (p.Leu189Trpfs*13) 移码突变 暂无可靠数据 可能导致蛋白截短
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

功能缺失型突变可能导致RPAP3蛋白功能丧失,影响R2TP复合物组装和转录调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RPAP3存在功能获得型突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明RPAP3存在显性负效应突变。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006351 (transcription • DNA-templated)
• GO:0006355 (regulation of transcription • DNA-templated)

相关通路

R2TP complex pathway
PI3K/Akt signaling pathway
DNA damage response

蛋白质功能简介

RPAP3蛋白是R2TP复合物的一个亚基,该复合物包含RUVBL1、RUVBL2、RPAP3和PIH1D1。R2TP复合物参与多种蛋白质复合物的组装,包括RNA聚合酶II、PI3K样激酶(如ATM、ATR、mTOR)和端粒酶。RPAP3通过其蛋白相互作用域与这些靶标结合,并协助其正确折叠和组装。此外,RPAP3还参与DNA损伤应答和细胞周期调控。

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