RPF1基因|核糖体组装因子功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RPF1是核糖体生物发生的关键因子,参与60S核糖体亚基的成熟,其功能异常与核糖体病和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 RPF1
基因全名 ribosome production factor 1 homolog
基因类型 protein-coding
染色体位置 1p32.3
NCBI Gene ID 80183 ncbi.nlm.nih.gov/gene/80183
Ensembl ID ENSG00000116132
UniProt ID Q9BYM8
OMIM ID 610610
HGNC ID 21309
基因别名 BAP28, FLJ12806, MGC117215

基因功能与研究简介

RPF1(ribosome production factor 1 homolog)编码一种核糖体生物发生因子,参与60S核糖体亚基的成熟。该蛋白在核仁中定位,与多种核糖体组装因子相互作用,确保核糖体RNA加工和核糖体亚基的正确组装。RPF1功能异常可能导致核糖体生物发生缺陷,进而影响蛋白质合成,与某些遗传性疾病和癌症相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
核糖体病 RPF1突变可能导致核糖体生物发生异常,影响蛋白质合成,与核糖体病相关。 暂无明确证据
癌症 RPF1在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响核糖体功能促进肿瘤发生发展。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
睾丸 暂无可靠数据 高表达
骨髓 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
HEK293 暂无可靠数据 胚胎肾细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Thr412Ala) 错义突变 罕见 可能影响蛋白稳定性
c.567delC (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致RPF1蛋白功能丧失或减弱,影响核糖体组装。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005730 nucleolus • GO:0006364 rRNA processing
• GO:0042254 ribosome biogenesis • GO:0003723 RNA binding

相关通路

Ribosome biogenesis (Reactome: R-HSA-6791226)
rRNA processing (Reactome: R-HSA-6791226)

蛋白质功能简介

RPF1蛋白定位于核仁,参与60S核糖体亚基的成熟。它可能作为核糖体组装因子,与多种蛋白相互作用,确保核糖体RNA的正确加工和核糖体亚基的组装。RPF1的功能异常可能导致核糖体生物发生缺陷,影响细胞蛋白质合成,进而与疾病发生相关。

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