RPGRIP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RPGRIP1是视网膜纤毛关键蛋白,其突变导致Leber先天性黑矇和视网膜色素变性,是基因治疗的重要靶点。

基因信息卡

基因符号 RPGRIP1
基因全名 RPGRIP1 (RPGR Interacting Protein 1)
基因类型 protein-coding
染色体位置 14q11.2
NCBI Gene ID 57096 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57096
Ensembl ID ENSG00000127990
UniProt ID Q96KN7
OMIM ID 605446
HGNC ID 13458
基因别名 CORD13, LCA6, RPGRIP1, RPGRIP1a, RPGRIP1b

基因功能与研究简介

RPGRIP1基因编码RPGR相互作用蛋白1,该蛋白是视网膜光感受器纤毛的重要组成部分,参与蛋白运输和信号转导。RPGRIP1突变与多种遗传性视网膜疾病相关,包括Leber先天性黑矇(LCA)和视网膜色素变性(RP)。该基因在视网膜中高表达,对维持光感受器功能至关重要。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
Leber先天性黑矇6型 RPGRIP1突变导致纤毛功能异常,影响光感受器发育和功能,导致严重视力障碍。 已明确致病
视网膜色素变性 RPGRIP1突变可导致常染色体隐性遗传的视网膜色素变性,表现为进行性视野缺损和夜盲。 已明确致病
锥杆细胞营养不良 部分RPGRIP1突变与锥杆细胞营养不良相关,表现为视力下降和色觉异常。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
视网膜 暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 低表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
ARPE-19 暂无可靠数据 视网膜色素上皮细胞系
Y79 暂无可靠数据 视网膜母细胞瘤细胞系
HEK293 暂无可靠数据 人胚胎肾细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2236C>T (p.Arg746Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2404delA (p.Ser802ValfsTer2) 移码突变 罕见 Loss of Function
c.1237G>A (p.Gly413Arg) 错义突变 罕见 可能为Loss of Function
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

导致蛋白截短或功能丧失,是RPGRIP1相关疾病的主要机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005813 (centrosome)
• GO:0005856 (cytoskeleton) • GO:0005929 (cilium)
• GO:0007601 (visual perception) • GO:0016020 (membrane)
• GO:0032391 (photoreceptor outer segment) • GO:0042995 (cell projection)
• GO:0050896 (response to stimulus)

相关通路

Ciliary landscape (Reactome: R-HSA-5620924)
Phototransduction cascade (KEGG: hsa04744)

蛋白质功能简介

RPGRIP1蛋白包含卷曲螺旋结构域和C端RPGR相互作用结构域,定位于光感受器连接纤毛。它与RPGR相互作用,参与纤毛内蛋白运输,对光感受器外节盘膜的更新和维持至关重要。RPGRIP1突变导致蛋白功能丧失,破坏纤毛运输,最终引起光感受器死亡。

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