RPGRIP1基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RPGRIP1是视网膜纤毛关键蛋白,其突变导致Leber先天性黑矇和视网膜色素变性,是基因治疗的重要靶点。
基因信息卡
| 基因符号 | RPGRIP1 |
|---|---|
| 基因全名 | RPGRIP1 (RPGR Interacting Protein 1) |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 14q11.2 |
| NCBI Gene ID | 57096 ncbi.nlm.nih.gov/gene/57096 |
| Ensembl ID | ENSG00000127990 |
| UniProt ID | Q96KN7 |
| OMIM ID | 605446 |
| HGNC ID | 13458 |
| 基因别名 | CORD13, LCA6, RPGRIP1, RPGRIP1a, RPGRIP1b |
基因功能与研究简介
RPGRIP1基因编码RPGR相互作用蛋白1,该蛋白是视网膜光感受器纤毛的重要组成部分,参与蛋白运输和信号转导。RPGRIP1突变与多种遗传性视网膜疾病相关,包括Leber先天性黑矇(LCA)和视网膜色素变性(RP)。该基因在视网膜中高表达,对维持光感受器功能至关重要。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| Leber先天性黑矇6型 | RPGRIP1突变导致纤毛功能异常,影响光感受器发育和功能,导致严重视力障碍。 | 已明确致病 |
| 视网膜色素变性 | RPGRIP1突变可导致常染色体隐性遗传的视网膜色素变性,表现为进行性视野缺损和夜盲。 | 已明确致病 |
| 锥杆细胞营养不良 | 部分RPGRIP1突变与锥杆细胞营养不良相关,表现为视力下降和色觉异常。 | 具有较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| Y79 | 暂无可靠数据 | 视网膜母细胞瘤细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 人胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.2236C>T (p.Arg746Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.2404delA (p.Ser802ValfsTer2) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.1237G>A (p.Gly413Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能为Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致蛋白截短或功能丧失,是RPGRIP1相关疾病的主要机制。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005813 (centrosome) |
| • GO:0005856 (cytoskeleton) | • GO:0005929 (cilium) |
| • GO:0007601 (visual perception) | • GO:0016020 (membrane) |
| • GO:0032391 (photoreceptor outer segment) | • GO:0042995 (cell projection) |
| • GO:0050896 (response to stimulus) |
相关通路
• Ciliary landscape (Reactome: R-HSA-5620924)
• Phototransduction cascade (KEGG: hsa04744)
蛋白质功能简介
RPGRIP1蛋白包含卷曲螺旋结构域和C端RPGR相互作用结构域,定位于光感受器连接纤毛。它与RPGR相互作用,参与纤毛内蛋白运输,对光感受器外节盘膜的更新和维持至关重要。RPGRIP1突变导致蛋白功能丧失,破坏纤毛运输,最终引起光感受器死亡。
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