RPGRIP1L基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RPGRIP1L基因编码纤毛过渡区蛋白,其突变与肾消耗病、视网膜色素变性等多种纤毛病相关。

基因信息卡

基因符号 RPGRIP1L
基因全名 RPGRIP1 like
基因类型 protein-coding
染色体位置 16q12.2
NCBI Gene ID 23322 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23322
Ensembl ID ENSG00000103490
UniProt ID Q68CZ1
OMIM ID 610937
HGNC ID 29158
基因别名 DFNB66, FTM, JBTS7, MKS5, NPHP8, PP3935

基因功能与研究简介

RPGRIP1L基因编码一种定位于初级纤毛过渡区的蛋白质,参与纤毛形成和信号转导。该基因突变可导致多种纤毛病,包括肾消耗病(NPHP)、Joubert综合征(JBTS)、Meckel综合征(MKS)和视网膜色素变性(RP)。RPGRIP1L在纤毛功能中起关键作用,其异常影响多个器官系统。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肾消耗病(Nephronophthisis) RPGRIP1L突变导致纤毛功能异常,影响肾小管发育和功能,引起肾消耗病。 已明确致病
Joubert综合征(Joubert Syndrome) RPGRIP1L突变导致小脑蚓部发育异常,引起Joubert综合征。 已明确致病
Meckel综合征(Meckel Syndrome) RPGRIP1L突变导致多器官发育异常,包括肾脏、肝脏和中枢神经系统。 已明确致病
视网膜色素变性(Retinitis Pigmentosa) RPGRIP1L突变影响感光细胞纤毛功能,导致视网膜变性。 已明确致病
肝纤维化(Hepatic Fibrosis) RPGRIP1L突变可能影响胆管纤毛功能,导致肝纤维化。 具有较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肾脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
视网膜 暂无可靠数据 暂无可靠数据
小脑 暂无可靠数据 暂无可靠数据
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
肾上皮细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
视网膜色素上皮细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
成纤维细胞 暂无可靠数据 暂无可靠数据
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.2404C>T (p.Arg802Ter) 无义突变 罕见 Loss of Function
c.2179G>A (p.Gly727Arg) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
c.1115T>C (p.Leu372Pro) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

Loss of Function(功能缺失):无义突变或移码突变导致蛋白截短或降解,使RPGRIP1L功能丧失,是主要致病机制。

Gain of Function(功能获得,GOF)

Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明RPGRIP1L突变具有功能获得效应。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明RPGRIP1L突变具有显性负性效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005813 (centrosome)
• GO:0005929 (cilium) • GO:0036064 (ciliary basal body)
• GO:0060271 (cilium assembly) • GO:0007224 (smoothened signaling pathway)

相关通路

Hedgehog signaling pathway (WP475)
Ciliopathy (WP453)

蛋白质功能简介

RPGRIP1L蛋白定位于初级纤毛的过渡区,与RPGRIP1相互作用,参与纤毛蛋白运输和信号转导。该蛋白对纤毛的形成和功能至关重要,其突变导致纤毛信号通路异常,进而引发多种纤毛病。

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