RPIA基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RPIA基因编码核糖-5-磷酸异构酶A,参与磷酸戊糖途径,其突变与核糖-5-磷酸异构酶缺乏症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RPIA |
|---|---|
| 基因全名 | ribose 5-phosphate isomerase A |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2p11.2 |
| NCBI Gene ID | 22934 ncbi.nlm.nih.gov/gene/22934 |
| Ensembl ID | ENSG00000115977 |
| UniProt ID | P49247 |
| OMIM ID | 180440 |
| HGNC ID | 10297 |
| 基因别名 | RPI; RPIAD; RPIA1 |
基因功能与研究简介
RPIA基因编码核糖-5-磷酸异构酶A,该酶催化核糖-5-磷酸和核酮糖-5-磷酸之间的可逆异构化反应,是磷酸戊糖途径(PPP)中的关键酶。磷酸戊糖途径是葡萄糖分解代谢的重要分支,主要产生NADPH和核糖-5-磷酸,前者用于还原性生物合成和抗氧化防御,后者是核苷酸和核酸合成的前体。RPIA的缺陷会导致核糖-5-磷酸异构酶缺乏症,一种罕见的常染色体隐性遗传病,表现为白质脑病和周围神经病变。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 核糖-5-磷酸异构酶缺乏症 | RPIA基因突变导致酶活性降低或缺失,影响磷酸戊糖途径,导致核糖-5-磷酸积累和核酮糖-5-磷酸减少,进而影响核苷酸合成和细胞代谢,主要影响神经系统。 | 已明确致病 |
| 癌症相关 | 有研究表明RPIA在多种肿瘤中表达异常,可能通过影响核苷酸合成和氧化还原平衡促进肿瘤生长,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 脑 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.149G>A (p.Arg50His) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响酶活性 |
| c.458C>T (p.Pro153Leu) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响酶活性 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 起始密码子突变 | 暂无可靠数据 | 可能导致蛋白质合成异常 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
Loss of Function(功能缺失):RPIA基因突变导致酶活性降低或完全丧失,影响磷酸戊糖途径的正常功能。
Gain of Function(功能获得,GOF)
Gain of Function(功能获得):目前暂无明确证据表明RPIA存在功能获得性突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
Dominant Negative(显性负性):目前暂无明确证据表明RPIA存在显性负性突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004751 ribose-5-phosphate isomerase activity | • GO:0005829 cytosol |
| • GO:0006098 pentose-phosphate shunt | • GO:0009052 pentose biosynthetic process |
相关通路
• Pentose phosphate pathway (hsa00030)
蛋白质功能简介
RPIA蛋白(UniProt P49247)由RPIA基因编码,属于核糖-5-磷酸异构酶家族。该蛋白在细胞质中发挥作用,催化核糖-5-磷酸与核酮糖-5-磷酸的相互转化。RPIA蛋白由约300个氨基酸组成,其三维结构包含α/β折叠,活性位点结合底物。RPIA的酶活性依赖于镁离子,其催化机制涉及底物开环和异构化。RPIA在细胞代谢中具有重要作用,其缺陷可导致核糖-5-磷酸异构酶缺乏症。
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| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|