RPL13A基因|核糖体蛋白L13a的功能、疾病关联与突变研究
RPL13A编码核糖体60S亚基蛋白L13a,参与蛋白质合成,其突变与先天性无巨核细胞血小板减少症等疾病相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RPL13A |
|---|---|
| 基因全名 | ribosomal protein L13a |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 19q13.33 |
| NCBI Gene ID | 23521 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23521 |
| Ensembl ID | ENSG00000142541 |
| UniProt ID | P40429 |
| OMIM ID | 180468 |
| HGNC ID | 10303 |
| 基因别名 | L13A, D16S44E, L13a, 60S ribosomal protein L13a |
基因功能与研究简介
RPL13A基因编码核糖体60S亚基的L13a蛋白,是核糖体组成成分之一,参与蛋白质合成。该基因突变与先天性无巨核细胞血小板减少症(CAMT)相关,表现为血小板减少和巨核细胞减少。此外,RPL13A在细胞增殖、凋亡和应激反应中可能具有非核糖体功能。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 先天性无巨核细胞血小板减少症 | RPL13A基因突变导致核糖体功能异常,影响巨核细胞生成,导致血小板减少。 | 已明确致病 |
| 骨髓增生异常综合征 | RPL13A表达异常可能参与疾病进展,但证据有限。 | 潜在关联 |
| 癌症 | RPL13A在多种肿瘤中表达上调,可能促进肿瘤增殖,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 高表达(基于GTEx) |
| 脾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| K562 | 暂无可靠数据 | 白血病细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.220C>T (p.Arg74Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.284G>A (p.Trp95Ter) | 无义突变 | 罕见 | Loss of Function |
| c.355_356del (p.Lys119fs) | 移码突变 | 罕见 | Loss of Function |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
导致核糖体蛋白L13a功能缺失或减少,影响核糖体生物合成和蛋白质翻译,进而影响细胞增殖和分化。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003735 (structural constituent of ribosome) | • GO:0005840 (ribosome) |
| • GO:0006412 (translation) | • GO:0002181 (cytoplasmic translation) |
相关通路
• hsa03010 (Ribosome)
• hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
蛋白质功能简介
RPL13A编码的蛋白质是核糖体60S亚基的组成部分,属于L13P家族。该蛋白参与蛋白质合成,并可能在细胞应激反应中发挥非核糖体功能。其突变可导致核糖体病,如先天性无巨核细胞血小板减少症。