RPL17-C18orf32基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究
RPL17-C18orf32是一个融合基因,编码核糖体蛋白L17和C18orf32蛋白,参与蛋白质合成,与多种癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RPL17-C18orf32 |
|---|---|
| 基因全名 | RPL17-C18orf32 readthrough |
| 基因类型 | 融合基因(readthrough) |
| 染色体位置 | 18q21.1 |
| NCBI Gene ID | 100526739 ncbi.nlm.nih.gov/gene/100526739 |
| Ensembl ID | ENSG00000267280 |
| UniProt ID | 暂无可靠数据 |
| OMIM ID | 暂无可靠数据 |
| HGNC ID | HGNC:40010 |
| 基因别名 | RPL17-C18orf32 readthrough |
基因功能与研究简介
RPL17-C18orf32是一个通过读穿机制产生的融合基因,由核糖体蛋白L17(RPL17)基因和C18orf32基因的部分序列融合而成。该基因编码的蛋白包含RPL17的N端区域和C18orf32的C端区域,可能具有核糖体蛋白和未知功能蛋白的双重特性。RPL17是核糖体60S大亚基的组成部分,参与蛋白质合成。C18orf32的功能尚不明确,但研究表明其可能参与细胞周期调控。该融合基因在多种癌症中表达异常,可能通过影响核糖体功能或细胞增殖参与肿瘤发生。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | RPL17-C18orf32融合基因在多种癌症中表达上调,可能通过影响核糖体生物发生和细胞增殖促进肿瘤发生。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | 在结直肠癌中检测到RPL17-C18orf32融合转录本,可能作为潜在的生物标志物。 | 潜在关联 |
| 乳腺癌 | 在乳腺癌细胞系中观察到RPL17-C18orf32表达异常,可能参与肿瘤进展。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 甲状腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肾上腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 暂无明确证据 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 | 暂无明确证据 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003735 (structural constituent of ribosome) | • GO:0006412 (translation) |
| • GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit) |
相关通路
• hsa03010 (Ribosome)
• hsa04110 (Cell cycle)
蛋白质功能简介
RPL17-C18orf32蛋白由融合基因编码,包含RPL17的N端区域和C18orf32的C端区域。RPL17是核糖体60S大亚基的组成部分,参与蛋白质合成。C18orf32的功能尚不明确,但可能参与细胞周期调控。该蛋白可能定位于细胞质核糖体,参与翻译过程。由于融合基因的存在,该蛋白可能具有异常功能,影响核糖体生物发生和细胞增殖。