RPN2基因|基因功能、疾病关联、突变与药物靶点研究
RPN2(核糖体蛋白L27a)是核糖体60S亚基的组成成分,参与蛋白质合成,其异常表达与多种癌症的进展和耐药性相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RPN2 |
|---|---|
| 基因全名 | ribophorin II |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 20q11.23 |
| NCBI Gene ID | 6184 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6184 |
| Ensembl ID | ENSG00000101266 |
| UniProt ID | P04844 |
| OMIM ID | 180490 |
| HGNC ID | 10402 |
| 基因别名 | RPN2, RIBIIR, RIBII, RPN-II, SWP1 |
基因功能与研究简介
RPN2(核糖体蛋白L27a)是核糖体60S亚基的组成成分,参与蛋白质合成。RPN2基因位于染色体20q11.23,编码的蛋白质是N-寡糖转移酶复合物的组成部分,该复合物负责新合成蛋白质的N-糖基化。RPN2在多种癌症中高表达,与肿瘤进展、转移和耐药性相关。研究表明,RPN2通过调节蛋白质糖基化影响细胞信号通路,从而促进肿瘤生长和存活。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 乳腺癌 | RPN2在乳腺癌中高表达,与肿瘤进展和耐药性相关。研究表明RPN2通过调节蛋白质糖基化影响细胞信号通路,从而促进肿瘤生长和存活。 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RPN2在非小细胞肺癌中表达上调,与不良预后相关。可能通过影响细胞凋亡和增殖促进肿瘤发展。 | 较强研究证据 |
| 结直肠癌 | RPN2在结直肠癌中表达升高,与肿瘤分期和转移相关。可能通过调节Wnt信号通路影响肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 胃癌 | RPN2在胃癌中高表达,与肿瘤侵袭和转移相关。可能通过调节上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤进展。 | 较强研究证据 |
| 肝癌 | RPN2在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤复发和不良预后相关。可能通过调节PI3K/AKT信号通路影响肿瘤生长。 | 较强研究证据 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肝 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
| MKN45 | 暂无可靠数据 | 胃癌细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Cys) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质功能,但具体影响未知 |
| c.456G>A (p.Val152Met) | 错义突变 | 暂无可靠数据 | 可能影响蛋白质稳定性或功能 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
暂无明确证据表明RPN2突变导致功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RPN2突变导致功能获得。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RPN2突变具有显性负效应。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003735 (structural constituent of ribosome) | • GO:0004576 (oligosaccharyl transferase activity) |
| • GO:0005783 (endoplasmic reticulum) | • GO:0005840 (ribosome) |
| • GO:0006487 (protein N-linked glycosylation) | • GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane) |
相关通路
• hsa03010 (Ribosome)
• hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)
蛋白质功能简介
RPN2编码的蛋白质是核糖体60S亚基的组成部分,也是N-寡糖转移酶复合物的亚基。该复合物位于内质网,负责将寡糖转移到新合成的蛋白质上,进行N-糖基化修饰。RPN2在蛋白质合成和糖基化中起关键作用,其异常表达可能影响细胞信号通路,与肿瘤发生发展相关。
相关产品
| 产品名称 | 货号 | 物种 | 基因 ID |
|---|