RPN2基因|基因功能、疾病关联、突变与药物靶点研究

RPN2(核糖体蛋白L27a)是核糖体60S亚基的组成成分,参与蛋白质合成,其异常表达与多种癌症的进展和耐药性相关。

基因信息卡

基因符号 RPN2
基因全名 ribophorin II
基因类型 protein-coding
染色体位置 20q11.23
NCBI Gene ID 6184 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6184
Ensembl ID ENSG00000101266
UniProt ID P04844
OMIM ID 180490
HGNC ID 10402
基因别名 RPN2, RIBIIR, RIBII, RPN-II, SWP1

基因功能与研究简介

RPN2(核糖体蛋白L27a)是核糖体60S亚基的组成成分,参与蛋白质合成。RPN2基因位于染色体20q11.23,编码的蛋白质是N-寡糖转移酶复合物的组成部分,该复合物负责新合成蛋白质的N-糖基化。RPN2在多种癌症中高表达,与肿瘤进展、转移和耐药性相关。研究表明,RPN2通过调节蛋白质糖基化影响细胞信号通路,从而促进肿瘤生长和存活。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
乳腺癌 RPN2在乳腺癌中高表达,与肿瘤进展和耐药性相关。研究表明RPN2通过调节蛋白质糖基化影响细胞信号通路,从而促进肿瘤生长和存活。 较强研究证据
肺癌 RPN2在非小细胞肺癌中表达上调,与不良预后相关。可能通过影响细胞凋亡和增殖促进肿瘤发展。 较强研究证据
结直肠癌 RPN2在结直肠癌中表达升高,与肿瘤分期和转移相关。可能通过调节Wnt信号通路影响肿瘤进展。 较强研究证据
胃癌 RPN2在胃癌中高表达,与肿瘤侵袭和转移相关。可能通过调节上皮-间质转化(EMT)促进肿瘤进展。 较强研究证据
肝癌 RPN2在肝细胞癌中表达上调,与肿瘤复发和不良预后相关。可能通过调节PI3K/AKT信号通路影响肿瘤生长。 较强研究证据

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
MKN45 暂无可靠数据 胃癌细胞系
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.123C>T (p.Arg41Cys) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质功能,但具体影响未知
c.456G>A (p.Val152Met) 错义突变 暂无可靠数据 可能影响蛋白质稳定性或功能
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

暂无明确证据表明RPN2突变导致功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据表明RPN2突变导致功能获得。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据表明RPN2突变具有显性负效应。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003735 (structural constituent of ribosome) • GO:0004576 (oligosaccharyl transferase activity)
• GO:0005783 (endoplasmic reticulum) • GO:0005840 (ribosome)
• GO:0006487 (protein N-linked glycosylation) • GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane)

相关通路

hsa03010 (Ribosome)
hsa04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum)

蛋白质功能简介

RPN2编码的蛋白质是核糖体60S亚基的组成部分,也是N-寡糖转移酶复合物的亚基。该复合物位于内质网,负责将寡糖转移到新合成的蛋白质上,进行N-糖基化修饰。RPN2在蛋白质合成和糖基化中起关键作用,其异常表达可能影响细胞信号通路,与肿瘤发生发展相关。

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