RPRD2基因|基因功能、疾病关联、突变与表达研究

RPRD2(Regulation of Nuclear Pre-mRNA Domain Containing 2)是转录调控和RNA加工过程中的关键因子,其突变与神经发育障碍和癌症相关。

基因信息卡

基因符号 RPRD2
基因全名 Regulation of Nuclear Pre-mRNA Domain Containing 2
基因类型 蛋白编码基因
染色体位置 1q21.2
NCBI Gene ID 23248 ncbi.nlm.nih.gov/gene/23248
Ensembl ID ENSG00000116774
UniProt ID Q9NQZ2
OMIM ID 614503
HGNC ID 29029
基因别名 FLJ20035, KIAA0186, RPRD2

基因功能与研究简介

RPRD2(Regulation of Nuclear Pre-mRNA Domain Containing 2)基因编码一种参与转录调控和RNA加工的蛋白质。该蛋白含有CTD(C端结构域)相互作用结构域,能够与RNA聚合酶II的C端结构域结合,从而影响转录延伸和mRNA加工。RPRD2在多种组织中表达,尤其在脑和睾丸中高表达。研究表明,RPRD2可能通过调控基因表达参与神经发育和肿瘤发生。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
神经发育障碍 RPRD2突变可能导致神经发育异常,但具体机制尚不明确。 ClinVar中有致病性变异记录,但证据有限。
癌症 RPRD2在多种癌症中表达异常,可能通过影响转录调控参与肿瘤发生。 COSMIC数据库中有体细胞突变记录,但功能影响尚待研究。

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 高表达
睾丸 暂无可靠数据 高表达
暂无可靠数据 中等表达
暂无可靠数据 中等表达
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HEK293 暂无可靠数据 常用细胞系
HeLa 暂无可靠数据 常用细胞系
K562 暂无可靠数据 白血病细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.1234A>G (p.Lys412Glu) 错义突变 罕见 可能影响蛋白功能,但具体影响未知。
c.567del (p.Leu189fs) 移码突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失。
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

移码突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响转录调控。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0006351 (transcription • DNA-templated)
• GO:0006397 (mRNA processing)

相关通路

hsa03040 (Spliceosome)
hsa03022 (Basal transcription factors)

蛋白质功能简介

RPRD2蛋白含有CTD相互作用结构域,能够与RNA聚合酶II的C端结构域结合,参与转录延伸和mRNA加工的调控。该蛋白可能通过影响基因表达参与神经发育和肿瘤发生。

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