RPRM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究

RPRM(Reprimo)是一种p53下游效应基因,参与细胞周期调控和DNA损伤应答,在多种癌症中因启动子甲基化而沉默,是潜在的肿瘤抑制因子。

基因信息卡

基因符号 RPRM
基因全名 reprimino, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate
基因类型 protein-coding
染色体位置 2q23.3
NCBI Gene ID 56475 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56475
Ensembl ID ENSG00000177575
UniProt ID Q9NS64
OMIM ID 610940
HGNC ID 17075
基因别名 REPRIMO

基因功能与研究简介

RPRM(Reprimo)是p53下游效应基因,编码一个参与细胞周期调控的蛋白。在DNA损伤时,p53诱导RPRM表达,导致细胞周期阻滞在G2期。RPRM在多种肿瘤中因启动子甲基化而表达沉默,提示其可能作为肿瘤抑制因子。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
胃癌 RPRM启动子甲基化导致表达沉默,与胃癌发生相关 较强研究证据
肺癌 RPRM甲基化与肺癌风险相关 较强研究证据
乳腺癌 RPRM甲基化在乳腺癌中常见,可能参与肿瘤发生 潜在关联
结直肠癌 RPRM甲基化与结直肠癌相关 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
暂无可靠数据 暂无可靠数据
暂无可靠数据 暂无可靠数据
乳腺 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HeLa 暂无可靠数据 宫颈癌细胞系
A549 暂无可靠数据 肺癌细胞系
MCF7 暂无可靠数据 乳腺癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
启动子甲基化 表观遗传修饰 常见 基因沉默,功能丧失
c.1A>G (p.Met1Val) 错义突变 罕见 可能影响蛋白翻译起始,功能未知
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

启动子甲基化导致基因沉默,功能丧失。

Gain of Function(功能获得,GOF)

暂无明确证据。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

暂无明确证据。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0005515 (protein binding) • GO:0005634 (nucleus)
• GO:0005737 (cytoplasm) • GO:0007049 (cell cycle)
• GO:0008283 (cell population proliferation)

相关通路

p53 signaling pathway (hsa04115)
Cell cycle (hsa04110)

蛋白质功能简介

RPRM蛋白定位于细胞核和细胞质,参与细胞周期G2/M检查点调控。在DNA损伤时,p53诱导RPRM表达,导致细胞周期阻滞。RPRM可能通过抑制Cdc2/cyclin B1复合物的活性来发挥作用。

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