RPRM基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RPRM(Reprimo)是一种p53下游效应基因,参与细胞周期调控和DNA损伤应答,在多种癌症中因启动子甲基化而沉默,是潜在的肿瘤抑制因子。
基因信息卡
| 基因符号 | RPRM |
|---|---|
| 基因全名 | reprimino, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 2q23.3 |
| NCBI Gene ID | 56475 ncbi.nlm.nih.gov/gene/56475 |
| Ensembl ID | ENSG00000177575 |
| UniProt ID | Q9NS64 |
| OMIM ID | 610940 |
| HGNC ID | 17075 |
| 基因别名 | REPRIMO |
基因功能与研究简介
RPRM(Reprimo)是p53下游效应基因,编码一个参与细胞周期调控的蛋白。在DNA损伤时,p53诱导RPRM表达,导致细胞周期阻滞在G2期。RPRM在多种肿瘤中因启动子甲基化而表达沉默,提示其可能作为肿瘤抑制因子。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 胃癌 | RPRM启动子甲基化导致表达沉默,与胃癌发生相关 | 较强研究证据 |
| 肺癌 | RPRM甲基化与肺癌风险相关 | 较强研究证据 |
| 乳腺癌 | RPRM甲基化在乳腺癌中常见,可能参与肿瘤发生 | 潜在关联 |
| 结直肠癌 | RPRM甲基化与结直肠癌相关 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 胃 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 乳腺 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
| 结肠 | 暂无可靠数据 | 暂无可靠数据 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
| MCF7 | 暂无可靠数据 | 乳腺癌细胞系 |
| HCT116 | 暂无可靠数据 | 结直肠癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| 启动子甲基化 | 表观遗传修饰 | 常见 | 基因沉默,功能丧失 |
| c.1A>G (p.Met1Val) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白翻译起始,功能未知 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
启动子甲基化导致基因沉默,功能丧失。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0005515 (protein binding) | • GO:0005634 (nucleus) |
| • GO:0005737 (cytoplasm) | • GO:0007049 (cell cycle) |
| • GO:0008283 (cell population proliferation) |
相关通路
• p53 signaling pathway (hsa04115)
• Cell cycle (hsa04110)
蛋白质功能简介
RPRM蛋白定位于细胞核和细胞质,参与细胞周期G2/M检查点调控。在DNA损伤时,p53诱导RPRM表达,导致细胞周期阻滞。RPRM可能通过抑制Cdc2/cyclin B1复合物的活性来发挥作用。
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