RPS13基因|核糖体蛋白S13功能、疾病关联、突变与表达研究

RPS13编码核糖体40S小亚基蛋白S13,参与蛋白质合成,其突变与多种癌症及发育异常相关。

基因信息卡

基因符号 RPS13
基因全名 ribosomal protein S13
基因类型 protein-coding
染色体位置 11p15.1
NCBI Gene ID 6207 ncbi.nlm.nih.gov/gene/6207
Ensembl ID ENSG00000197756
UniProt ID P62277
OMIM ID 180476
HGNC ID 10386
基因别名 S13

基因功能与研究简介

RPS13基因编码核糖体40S小亚基的S13蛋白,是核糖体的核心成分,参与mRNA翻译的起始和延伸过程。该基因位于染色体11p15.1,其表达水平与细胞增殖和生长密切相关。研究表明,RPS13的异常表达或突变与多种肿瘤的发生发展有关,如肝癌、结直肠癌等,可能通过影响核糖体生物合成和蛋白质翻译效率,进而调控细胞周期和凋亡。此外,RPS13还参与p53/TP53信号通路的调控,与核糖体应激反应相关。

疾病关联

疾病类别 疾病生理机制 基因组证据
肝细胞癌 RPS13在肝癌组织中高表达,可能通过促进核糖体生物合成和蛋白质合成,加速肿瘤细胞增殖。 较强研究证据
结直肠癌 RPS13表达上调与结直肠癌的进展和不良预后相关,可能通过影响Wnt/β-catenin信号通路。 较强研究证据
钻石-布莱克范贫血 RPS13基因突变可能导致核糖体功能障碍,影响红细胞生成,与DBA相关。 已明确致病
黑色素瘤 RPS13在黑色素瘤中表达异常,可能参与肿瘤转移和耐药。 潜在关联

表达谱

组织表达
组织 nTPM 级别
肝脏 暂无可靠数据 暂无可靠数据
结肠 暂无可靠数据 暂无可靠数据
骨髓 暂无可靠数据 暂无可靠数据
皮肤 暂无可靠数据 暂无可靠数据
细胞系表达
细胞系 nTPM 笔记
HepG2 暂无可靠数据 肝癌细胞系
HCT116 暂无可靠数据 结直肠癌细胞系
K562 暂无可靠数据 慢性粒细胞白血病细胞系
A375 暂无可靠数据 黑色素瘤细胞系
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)

突变与遗传变异

Hotspot Mutations
变体 类型 频率 功能描述
c.284A>G (p.Asp95Gly) 错义突变 罕见 可能影响蛋白结构,导致功能异常
c.307C>T (p.Arg103Trp) 错义突变 罕见 可能影响核糖体组装,与DBA相关
c.1A>G (p.Met1Val) 起始密码子突变 罕见 可能导致蛋白截短,功能丧失
突变功能分类

Loss of Function(功能缺失,LOF)

RPS13的错义突变或截短突变可能导致蛋白功能丧失,影响核糖体组装和翻译效率,与DBA等疾病相关。

Gain of Function(功能获得,GOF)

目前暂无明确证据表明RPS13存在功能获得性突变。

Dominant Negative(显性负效应,DN)

部分突变可能通过显性负效应干扰核糖体功能,但具体机制尚需进一步研究。

基因本体论 (Gene Ontology)

• GO:0003735 (structural constituent of ribosome) • GO:0006412 (translation)
• GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit) • GO:0005840 (ribosome)

相关通路

hsa03010 (Ribosome)
hsa04151 (PI3K-Akt signaling pathway)
hsa05200 (Pathways in cancer)

蛋白质功能简介

RPS13蛋白是核糖体40S小亚基的组成部分,分子量约为17 kDa。它参与mRNA翻译的起始和延伸,对蛋白质合成至关重要。RPS13还参与核糖体应激反应,当核糖体生物合成受阻时,RPS13可能释放并激活p53通路,从而调控细胞周期和凋亡。此外,RPS13的异常表达与多种癌症相关,可能作为潜在的肿瘤标志物或治疗靶点。

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