RRAGD基因|基因功能、疾病关联、突变与药物靶点研究
RRAGD编码Rag GTP酶家族成员D,是mTORC1信号通路的关键调控因子,参与氨基酸感知与细胞生长调控,其突变与肾小管病变和肿瘤发生相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RRAGD |
|---|---|
| 基因全名 | Ras related GTP binding D |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 6q25.3 |
| NCBI Gene ID | 58528 ncbi.nlm.nih.gov/gene/58528 |
| Ensembl ID | ENSG00000125037 |
| UniProt ID | Q9NQL2 |
| OMIM ID | 618019 |
| HGNC ID | 19910 |
| 基因别名 | RagD; bA465B24.1 |
基因功能与研究简介
RRAGD基因编码Ras相关GTP结合蛋白D(RagD),是Rag GTP酶家族的成员之一。RagD与RagC形成异源二聚体,作为mTORC1信号通路的上游调控因子,在氨基酸充足时被激活,促进mTORC1转位至溶酶体表面,进而调控细胞生长、增殖和代谢。RRAGD在肾脏、骨骼肌和心脏等组织中高表达,其功能异常与肾小管病变和肿瘤发生密切相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 肾小管病变 | RRAGD突变导致mTORC1信号异常,影响肾小管上皮细胞代谢和功能,可能引起肾小管损伤和病变。 | ClinVar |
| 肿瘤 | RRAGD在多种肿瘤中表达异常,可能通过调控mTORC1通路影响肿瘤细胞增殖和存活。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨骼肌 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 心脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
| HeLa | 暂无可靠数据 | 常用细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.484C>T (p.Arg162Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响GTP结合活性,导致功能异常 |
| c.769G>A (p.Gly257Arg) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性或相互作用 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能缺失型突变:导致RRAGD蛋白活性降低或丧失,影响mTORC1信号通路的正常激活,可能引起细胞生长和代谢异常。
Gain of Function(功能获得,GOF)
功能获得型突变:增强RRAGD蛋白活性,导致mTORC1信号过度激活,可能促进肿瘤发生。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
显性负性突变:突变蛋白干扰正常RRAGD功能,抑制mTORC1信号通路,导致细胞功能异常。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0003924 GTPase activity | • GO:0005525 GTP binding |
| • GO:0032869 cellular response to amino acid stimulus | • GO:0038202 TORC1 signaling |
| • GO:0005764 lysosome | • GO:0005829 cytosol |
相关通路
• R-HSA-165159: mTOR signalling
• R-HSA-166208: mTORC1-mediated signalling
• R-HSA-1632852: Macroautophagy
蛋白质功能简介
RRAGD蛋白属于Rag GTP酶家族,包含GTPase结构域和C端结构域。在氨基酸充足时,RRAGD与RRAGC形成异源二聚体,被GATOR1复合物调控,激活mTORC1信号通路。RRAGD在肾脏中高表达,参与肾小管细胞对氨基酸的感应和代谢调控。其突变可能导致mTORC1信号异常,与肾小管病变和肿瘤发生相关。