RRH基因|基因功能、疾病关联、突变与基因编辑研究
RRH基因编码视黄醛还原酶,参与视觉循环和脂质代谢,与视网膜疾病和癌症相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RRH |
|---|---|
| 基因全名 | retinal pigment epithelium-derived rhodopsin homolog |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 15q26.1 |
| NCBI Gene ID | 8589 ncbi.nlm.nih.gov/gene/8589 |
| Ensembl ID | ENSG00000137807 |
| UniProt ID | Q8IYS2 |
| OMIM ID | 606556 |
| HGNC ID | 10464 |
| 基因别名 | RGR-r, RGR-rhodopsin, RP4-665J16.1 |
基因功能与研究简介
RRH基因编码一种视黄醛还原酶,属于短链脱氢酶/还原酶家族。该酶在视觉循环中参与视黄醛的代谢,将全反式视黄醛还原为全反式视黄醇,从而调节视觉色素的再生。此外,RRH在脂质代谢和细胞信号传导中也可能发挥作用。研究表明,RRH在视网膜色素上皮细胞中高表达,其功能异常可能与视网膜退行性疾病相关。近年来,RRH也被发现在多种癌症中表达异常,提示其可能参与肿瘤发生发展。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 视网膜色素变性 | RRH基因突变可能导致视觉循环障碍,影响视黄醛的再生,进而导致视网膜色素变性。 | OMIM |
| 癌症 | RRH在多种癌症中表达异常,可能通过影响脂质代谢和细胞增殖参与肿瘤发生。 | COSMIC |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 视网膜 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 肝脏 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肾脏 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| ARPE-19 | 暂无可靠数据 | 视网膜色素上皮细胞系 |
| HepG2 | 暂无可靠数据 | 肝癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123A>G (p.I41M) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白稳定性 |
| c.456C>T (p.R152W) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响酶活性 |
| c.789delC (p.L263fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能引起酶活性丧失,影响视觉循环。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据表明RRH存在功能获得型突变。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据表明RRH存在显性负效应突变。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0004030 (aldehyde reductase activity) | • GO:0007601 (visual perception) |
| • GO:0006629 (lipid metabolic process) | • GO:0005886 (plasma membrane) |
相关通路
• Retinol metabolism (hsa00830)
• Metabolic pathways (hsa01100)
蛋白质功能简介
RRH蛋白是一种视黄醛还原酶,属于短链脱氢酶/还原酶家族。该蛋白在视网膜色素上皮细胞中高表达,参与视觉循环中视黄醛的还原反应,将全反式视黄醛转化为全反式视黄醇,从而调节视觉色素的再生。此外,RRH可能参与脂质代谢和细胞信号传导。其蛋白结构包含保守的NAD(P)H结合域和催化残基,酶活性依赖于辅因子NADPH。