RRN3基因|基因功能、疾病关联、突变与转录调控研究
RRN3是RNA聚合酶I转录起始的关键因子,调控核糖体RNA合成,与癌症和发育异常相关。
基因信息卡
| 基因符号 | RRN3 |
|---|---|
| 基因全名 | RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor |
| 基因类型 | protein-coding |
| 染色体位置 | 16p13.3 |
| NCBI Gene ID | 54700 ncbi.nlm.nih.gov/gene/54700 |
| Ensembl ID | ENSG00000103174 |
| UniProt ID | Q9NYV6 |
| OMIM ID | 605121 |
| HGNC ID | 17062 |
| 基因别名 | TIF-IA, A-270G1.2 |
基因功能与研究简介
RRN3(RNA聚合酶I转录因子同源物)是RNA聚合酶I(Pol I)转录起始的关键因子,负责将Pol I招募到核糖体DNA(rDNA)启动子,从而启动核糖体RNA(rRNA)的转录。RRN3的活性受多种信号通路调控,包括mTOR和MAPK通路,其表达水平与细胞增殖和生长密切相关。研究表明,RRN3在多种癌症中表达上调,可能通过促进rRNA合成支持肿瘤细胞的高代谢需求。此外,RRN3的突变或表达异常与某些发育异常和疾病相关。
疾病关联
| 疾病类别 | 疾病生理机制 | 基因组证据 |
|---|---|---|
| 癌症 | RRN3在多种癌症中表达上调,可能通过促进rRNA合成支持肿瘤细胞增殖。 | 较强研究证据 |
| 发育异常 | RRN3功能缺失可能导致核糖体生物发生障碍,影响胚胎发育。 | 潜在关联 |
| 神经退行性疾病 | RRN3表达异常可能影响神经元功能,但具体机制尚不明确。 | 潜在关联 |
表达谱
组织表达
| 组织 | nTPM | 级别 |
|---|---|---|
| 睾丸 | 暂无可靠数据 | 高表达 |
| 骨髓 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 肺 | 暂无可靠数据 | 中等表达 |
| 脑 | 暂无可靠数据 | 低表达 |
细胞系表达
| 细胞系 | nTPM | 笔记 |
|---|---|---|
| HeLa | 暂无可靠数据 | 宫颈癌细胞系 |
| HEK293 | 暂无可靠数据 | 胚胎肾细胞系 |
| A549 | 暂无可靠数据 | 肺癌细胞系 |
数据来源:Human Protein Atlas(proteinatlas.org)
突变与遗传变异
Hotspot Mutations
| 变体 | 类型 | 频率 | 功能描述 |
|---|---|---|---|
| c.123C>T (p.Arg41Trp) | 错义突变 | 罕见 | 可能影响蛋白功能 |
| c.456delA (p.Lys152fs) | 移码突变 | 罕见 | 导致蛋白截短,功能丧失 |
突变功能分类
Loss of Function(功能缺失,LOF)
功能丧失型突变,如移码突变导致蛋白截短,可能降低RRN3活性,影响rRNA转录。
Gain of Function(功能获得,GOF)
暂无明确证据。
Dominant Negative(显性负效应,DN)
暂无明确证据。
查看完整突变数据:
基因本体论 (Gene Ontology)
| • GO:0000993 (RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding) | • GO:0006361 (transcription initiation at RNA polymerase I promoter) |
| • GO:0005730 (nucleolus) |
相关通路
• hsa03020: RNA polymerase
• hsa04150: mTOR signaling pathway
蛋白质功能简介
RRN3蛋白(UniProt Q9NYV6)由约650个氨基酸组成,包含多个磷酸化位点,其活性受磷酸化调控。RRN3与Pol I复合物相互作用,在转录起始时促进启动子解链和RNA合成。RRN3的核仁定位对于其功能至关重要。
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